Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Caracterización molecular de una nueva forma de policétido sintasa de tipo III de Zingiber Officinale Rosc. y su análisis mediante método bioinformático

Las enzimas de la superfamilia de las policétido sintasas tipo III juegan un papel importante en la biosíntesis de productos naturales medicinales en plantas. Las PKS generan la diversidad de derivados de policétido cambiando su preferencia por moléculas iniciadoras, el número de adiciones de acetilo catalizadas y la ciclación de los intermedios de policétido. Las sorprendentes características estructurales del gingerol y los compuestos relacionados del jengibre (Zingiber officinale Rosc., Zingiberaceae) proporcionan una visión genómica de la presencia de nuevas formas de PKS. El estudio actual describe el aislamiento y la caracterización de una novela de PKS de Z. officinale utilizando un método de PCR basado en oligonucleótidos degenerados. La expresión inducible de ZoPKS recombinante en E. coli dio como resultado la formación de una proteína con un peso molecular aproximado de 43 kD. La secuencia comparativa y el análisis filogenético de ZoPKS muestran su variación significativa con respecto a las PKS ya identificadas. La novedad de ZoPKS se confirmó aún más mediante el análisis bioinformático estructural comparativo basado en modelos de homología. La nueva forma de PKS identificada en el estudio tiene sustituciones de aminoácidos muy notables en los residuos clave que determinan la selectividad del sustrato iniciador y las reacciones de condensación y forma una base genómica de PKS de Z. officinale para explorar su potencial en la biosíntesis de gingerol y compuestos relacionados.