Avances en Ingeniería Genética

Avances en Ingeniería Genética
Acceso abierto

ISSN: 2169-0111

abstracto

Genomics 2019: Quantitative gene and environment interactions in Freshwater Prawns, Macrobrachium rosenbergii from laboratory to farm management

Tahereh Alinejad

En este examen, el impacto de la temperatura del agua y las variables ecológicas en la articulación de calidad insusceptible en el camarón de agua dulce (Macrobrachium rosenbergii) se estimó mediante quince cualidades resistentes básicas. La calidad fue seleccionada y planificada por nuestra investigación anterior sobre el transcriptoma de M.rosenbergiiinformación y proteoma. La prueba de laboratorio sobre el impacto de varias temperaturas presentadas a los camarones de agua dulce se aplicó al hábitat indígena del rancho de camarones de agua dulce. Se eligieron para examinar dos ranchos distintos según la norma y la práctica de administración y hardware no estándar. Se orquestó una variedad de pruebas en varios lapsos de tiempo del día en varias temperaturas del agua desde 24 °C hasta 32 °C. La conexión climática de calidad del sistema invulnerable de gambas de agua dulce contra el aturdimiento por calor y los sistemas de placa se concentró mediante la aplicación de perfiles de articulación de calidad diferencial (Fluidigm Biomark HD) en tres órganos únicos que son el suero, el hepatopáncreas y el músculo. El resultado afirmó que el aumento de la temperatura del agua afecta directamente las reacciones insensibles de los camarones de agua dulce. Asimismo, el impacto de las diversas temperaturas del agua en la articulación de calidad en el suero, el hepatopáncreas y el músculo de los camarones de agua dulce se examinó adicionalmente mediante un examen de articulación de calidad diferencial. Una correlación de los datos de articulación de calidad de los tres grupos indicó que las características de codificación de vías invulnerables estaban fundamentalmente controladas y las características de codificación de metabolitos esencialmente controladas en comparación con el aumento de la temperatura. Nuestro Una correlación de los datos de articulación de calidad de los tres grupos indicó que las características de codificación de vías invulnerables estaban fundamentalmente controladas y las características de codificación de metabolitos esencialmente controladas en comparación con el aumento de la temperatura. Nuestro Una correlación de los datos de articulación de calidad de los tres grupos indicó que las características de codificación de vías invulnerables estaban fundamentalmente controladas y las características de codificación de metabolitos esencialmente controladas en comparación con el aumento de la temperatura. NuestroLa investigación encontró una nueva asociación de calidad en la ruta de la lectina, que es la taquilectina como otra cualidad competidora potencial para el avance de los marcadores de presión naturales en el camarón de agua dulce. Esta investigación también brindó datos significativos sobre la articulación diferencial de la vía segura del nuevo langostino de agua gigante siguiendo la presión natural que ayudará a mejorar la comprensión de las relaciones climáticas de calidad en esta especie mediante el uso de 15 cualidades que se han planeado a partir del transcriptoma .información adquirida en un examen anterior. Además, el examen ecológico del rancho brindó datos importantes sobre el impacto de la suciedad y el contenido de agua, la alimentación del camarón y las técnicas de los ejecutivos en la mejora de la calidad invulnerable del camarón de agua dulce y el rendimiento del rancho.

Últimamente ha surgido una innovación de alto rendimiento, por ejemplo, la secuenciación de vanguardia (NGS), que se utiliza ampliamente en la investigación genómica y transcriptómica. La innovación de NGS también se puede utilizar para examinar la articulación de calidad diferencial en diferentes tejidos o ciertas condiciones, como estrés y contaminación por microorganismos, y en formas de vida modelo y no modelo. Hay lecturas transcriptómicas para camarones peneidos, por ejemplo, Peneaus monodon, Litopeneaus vannamei, Fenneropeneaus chinensis, Fenneropenaeus merguiensis y Marsupeneaus japonicus para investigar la articulación explícita de tejido, la reacción de presión y la enfermedad viral. Además, se han realizado numerosas investigaciones sobre el transcriptoma completo.secuenciación del hepatopáncreas de M. rosenbergii debido a la contaminación por Vibrio parahaemolyticus, hepatopáncreas y órgano linfoide a la luz de la infección por el trastorno de la mancha blanca (WSSV) y tejido intestinal a la luz del WSSV o la copia viral de PAMP (poli I:C). Más recientemente, se ha contemplado la investigación transcriptómica del tejido hematopoyético de langostinos adultos M. rosenbergii a la luz de la enfermedad de MrNV. Una gran cantidad de registros diferencialmente abundantes se ubicaron con otros instrumentos seguros, como receptores de reconocimiento de diseño, agentes de prevención del cáncer y péptidos antimicrobianos.

 

Para distinguir diferencialmente los registros de recompensas relacionados con la contaminación de MrNV, realizamos la secuenciación de ARN en seis recreaciones de cada PL sólida y, tentativamente, de PL contaminada con MrNV. Los resultados demostraron que 5538 registros se comunicaron de manera diferencial con 2413 registros dirigidos hacia arriba y 3125 registros controlados hacia abajo. Entre esos registros, una parte de ellos estaban comprometidos con el marco seguro natural debido a una enfermedad viral.

Para aprobar nuestros resultados de combinación de registros y riqueza diferencial, también elegimos nueve enfoques para su aprobación con qPCR, y mostramos una baja tasa de divulgación falsa en estas características. Tamizamos nuestra lista de DEG según lo indicado por grupos utilitarios de importancia que incluyen proteínas de reconocimiento de diseño (PRP) y proteína antiviral, estructura de profenol oxidasa (ProPO), las vías de señalización Toll-IMD, péptidos antimicrobianos (AMP) y estructura de coagulación de la sangre , fagocitosis y apoptosis, estructura del agente de prevención del cáncer y ARNimpedancia (ARNi). Varias investigaciones mostraron una alta relación entre la información de RNAseq y qPCR. Además, las investigaciones de RNAseq de M. rosenbergii debido a la contaminación bacteriana y viral también demostraron una alta relación entre los resultados de RNAseq y qPCR. Para mejorar nuestra certeza, aprobamos estos resultados en ejemplos orgánicos gratuitos. El espesamiento de la sangre es una reacción humoral que previene la desgracia de la hemolinfa y la propagación microbiana durante una lesión. En Scavanger, la coagulación de la sangre incluye la conexión cruzada del total de proteínas espesantes (CP) por la transglutaminasa subordinada al calcio (TGasa) administrada por el hemocito. Investigaciones anteriores indicaron que la articulación de la lisozima y la corteza en M. japonicus se controló a la baja en camarones agotados con TGasa, lo que sugiere que existe una conexión entre el marco de espesamiento de la sangre y los AMP. Descubrimos que la articulación de la isoforma X2 (HMCN1) de transglutaminasa y hemicentina-1 estaba controlada. Del mismo modo, aprobamos la declaración de HMCN1, que fue gestionada por 5.31-crease en RNAseq y 16.07-overlap por qPCR. Estos resultados recomendaron que estas dos partes de la coagulación de la sangre se incluyeran como una reacción a la contaminación de MrNV. Además, la guía ascendente de dos partes de la coagulación de la sangre, la lisozima y ciertas isoformas de la corteza pueden demostrar una conexión entre el marco de espesamiento de la sangre y los AMP en M. rosenbergii. Estos resultados recomendaron que estas dos partes de la coagulación de la sangre se incluyeran como una reacción a la contaminación de MrNV. Además, la guía ascendente de dos partes de la coagulación de la sangre, la lisozima y ciertas isoformas de la corteza pueden demostrar una conexión entre el marco de espesamiento de la sangre y los AMP en M. rosenbergii. Estos resultados recomendaron que estas dos partes de la coagulación de la sangre se incluyeran como una reacción a la contaminación de MrNV. Además, la guía ascendente de dos partes de la coagulación de la sangre, la lisozima y ciertas isoformas de la corteza pueden demostrar una conexión entre el marco de espesamiento de la sangre y los AMP en M. rosenbergii.

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