Revista de bioquímica y fisiología vegetal
Acceso abierto

abstracto

El promotor principal de Medicago sativa L. β-amilasa tiene motivos en común con los genes clave de degradación del almidón de Arabidopsis

Brett Fugate, Denise Medrano, Joyce Ache Gana, Aida Abraha y Suzanne M Cunningham

La β-amilasa es una enzima involucrada en la degradación del almidón transitorio en tejidos fotosintéticos de plantas y
se expresa en altos niveles en las raíces de Medicago sativa L. Cómo la β -El gen de la amilasa MsBAM1 está regulado en
las raíces no están claras. Los objetivos de este estudio fueron: aislar el promotor central de MsBAM1, descifrar motivos in silico
que están asociados con la respuesta específica de la raíz elevada, y para encontrar motivos comunes entre los promotores principales
de importantes genes de degradación del almidón en Medicago sativa MsBAM1 y Arabidopsis (AtGWD, AtPWD, AtMEX1,
AtBAM 1 &erio; 3 y AtISA3). Los cebadores se diseñaron a partir de genes de β-amilasa homólogos y se usaron en PCR con
ADNg de M. sativa. Las bandas de PCR purificadas en gel se secuenciaron, verificaron y anotaron. Los genes del almidón y la igualdad
La base de datos del sitio de unión del factor de transcripción analizó el número de promotores de genes que no contienen almidón de Arabidopsis
(LUGAR). Se analizaron estadísticamente las frecuencias de motivo entre genes de almidón y no almidón. Un motivo de caja TATA
se identificó en el promotor central MsBAM1. Los análisis de la prueba exacta de Fisher y chi-cuadrado revelaron la importancia de
la frecuencia de los motivos ROOTMOTIFTAPOX1 (RMP1) y GATABOX (GATA) entre almidón y no almidón
genes, pero no el motivo DOF. Los motivos RMP1 y GATA se detectaron en MsBAM1 y en todas las Arabidopsis
genes de degradación del almidón, pero solo en unos pocos genes que no son de almidón. Sin embargo, el motivo DOF se encontró en todos los almidones
y genes de degradación que no son de almidón en frecuencias similares. Estos motivos pueden funcionar en combinación con otros conocidos
Elementos reguladores cis para conferir expresión mejorada de raíz en raíces de alfalfa y regulación co-transcripcional en
vía de degradación del almidón