Transcriptómica: Acceso Abierto
Acceso abierto
ISSN: 2329-8936
ISSN: 2329-8936
Jérôme Schmeisser*1, Britt Blokker1, Christelle Iaconis1, Stéphane Etheve2 y Estefania Pérez Calvo1
Se exploraron los altos niveles dietéticos de vitamina B2 en el transcriptoma cecal de lechones destetados, para evaluar si una sobredosis de riboflavina podría llegar al intestino posterior y, en consecuencia, desencadenar una respuesta beneficiosa en el huésped. La expresión de genes cecales se evaluó utilizando microarrays de transcriptomas de Agilent , 14 y 28 días después de la suplementación en tres grupos experimentales; un grupo control (dosis recomendada de riboflavina: 10 mg/kg dieta), y dos grupos adicionalmente suplementados para alcanzar 50 o 100 mg/kg de riboflavina, respectivamente. Ambos niveles de suplementación cambiaron significativamente el patrón del transcriptoma cecal en comparación con el control. La dosis de 100 mg/kg dio como resultado el mayor número de genes expresados diferencialmente. En el día 14, los genes más modulados estaban relacionados conestrés oxidativo y respuesta inmune, confirmando el efecto antioxidante de la riboflavina. Además, se modularon las vías involucradas en la respuesta del huésped a los cambios en la microbiota, lo que indica los efectos moduladores de la riboflavina en el microbioma e, indirectamente, la respuesta del huésped. Finalmente, la dosis más alta de riboflavina desencadenó los mecanismos moleculares involucrados en el metabolismo de la aldosterona y los ácidos biliares, lo que demuestra el potencial de la vitamina B2 para mejorar el estado de salud del intestino posterior. Se encontró un menor impacto de la suplementación de 100 mg/kg de riboflavina en la expresión génica cecal en el día 28. Sin embargo, se mostraron algunas respuestas genéticas positivas frente al daño del ADN para ambos niveles de suplementación y algunas vías relacionadas con la señalización celular .fueron modulados. Los datos presentados en este estudio confirman que la superdosis de vitamina B2 afecta la fisiología cecal, y se necesita más investigación para respaldar los hallazgos de la posible modulación en la microbiota y el metabolismo de los ácidos biliares. En conclusión, la superdosis de vitamina B2 impacta positivamente en la respuesta del transcriptoma del ciego de los lechones destetados. Esto crea la oportunidad de considerar a la riboflavina como parte de una solución novedosa para reducir la incidencia y severidad de los problemas digestivos asociados al período inmediatamente posterior al destete.
Palabras clave: transcriptómica, microarray, lechones, riboflavina, vitamina
DEG: gen expresado diferencialmente
PCA: análisis de componentes principales
PCR: reacción en cadena de la polimerasa
UPLC: cromatografía líquida de ultra rendimiento
ARN: ácido ribonucleótido
LC/MS: cromatografía líquida /espectrometría de masas
Ct: Umbral de ciclo
RIN: Número de integridad de ARN
FDR: tasa de descubrimiento falso
KEGG: Enciclopedia de genes y genomas de Kioto
HSP: proteína de choque térmico
ROS: especies reactivas de oxígeno
BA: ácido biliar