Journal of Molecular Imaging & Dynamics
Acceso abierto

abstracto

Aceleración del análisis de la morfología neuronal mediante el procesamiento paralelo

Wang DD, Bourke D, Domanski L y Vallotton P

Los investigadores que utilizan sistemas de detección de alto contenido generan miles de imágenes de células marcadas con fluorescencia a partir de las cuales miden cambios fenotípicos sutiles pero importantes resumidos por docenas de parámetros. Los grandes conjuntos de datos de imágenes y los requisitos de respuesta rápida han hecho que el análisis de alto contenido sea una tarea desafiante. Este documento estudia el análisis de imágenes de alto rendimiento basado en múltiples núcleos y su aplicación a los análisis de alto contenido de datos y computación intensiva. Se emplea una estrategia de paralelización vertical y se implementa un marco de paralelización automatizado para enviar automáticamente tareas de procesamiento de imágenes. La estrategia se basa en la asignación de diferentes imágenes a procesadores separados, de modo que cada imagen se analice secuencialmente en un solo procesador y múltiples imágenes sean procesadas por procesadores separados en paralelo. Los experimentos demuestran que este enfoque, de carácter genérico, aumenta considerablemente el rendimiento.