Virología y Micología
Acceso abierto

abstracto

QM/MM Docking Strategy y Prime/MM-GBSA Cálculo de Celecoxib Análogos como inhibidores de la N-miristoiltransferasa

Nisha Chandna, Kotni Meena Kumari, Chetan Sharma, Manga Vijjulatha, Jitander K. Kapoor y Pawan K. Sharma

El desarrollo de sustancias químicas que inhiben la N-miristoiltransferasa (Nmt) es un adyuvante terapéutico prometedor para mejorar la
eficacia y selectividad de los agentes antifúngicos. Predicción fiable de energía libre de unión y afinidad de unión de Nmt
los inhibidores pueden proporcionar una guía para el diseño racional de fármacos. En este estudio, Quantum Polarized Ligand Docking (QPLD)
la estrategia y los cálculos de Prime/Molecular Mechanics Generalized Born Surface Area (Prime/MM-GBSA) fueron
aplicado para predecir el modo de unión y la energía libre para una serie de análogos de celecoxib como inhibidores de Nmt que
También se encontró que tenían una buena actividad antiinflamatoria. El ensayo antifúngico in vitro indicó que estos derivados
también estaban actuando como potentes agentes antifúngicos. Los resultados de acoplamiento fiables mostraron un rendimiento superior en ambos ligandos
Pose de unión y precisión de puntaje de acoplamiento. Entonces, el método Prime/MM–GBSA basado en el complejo de acoplamiento fue
utilizado para predecir la energía libre de enlace. El uso combinado del acoplamiento QM/MM y el método Prime/MM-GBSA dio una
buena correlación entre la energía libre de unión predicha y la zona de inhibición determinada experimentalmente y
Valores de Concentración Inhibitoria Mínima (MIC). El acoplamiento molecular combinado con la simulación Prime/MM-GBSA
no solo se puede utilizar para predecir de forma rápida y precisa la energía libre de unión de los nuevos inhibidores de Nmt, sino también
proporcionar una estrategia novedosa para el descubrimiento de clientes potenciales y la optimización de Nmt.