Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Predicción y análisis comparativo de péptidos y epítopos de unión a MHC en nanoorganismos Nanoviridae

Dangre DM, Deshmukh SR, Rathod DP, Umare VD y Ullah I

Nanoviridae es una familia de virus de ADN monocatenario que infectan las plantas a través de sus tejidos floema. Los pocos miembros de estos virus ahora se están volviendo hacia los animales. Incluye dos géneros, Nanovirus y Babuvirus. El nanovirus incluye tres especies, a saber, el virus de los amarillos necróticos de las habas (FBNYV), el virus del enanismo de la arveja de leche (MVDV) y el virus del acrobacia del trébol subterráneo (SCSV), mientras que los babuvirus tienen dos especies contabilizadas todavía, a saber, el virus de la copa del racimo del abacá (ABTV) y el virus de la copa del racimo del plátano. (BBTV). Es probable que las proteínas de la cubierta viral sean responsables de muchas enfermedades tanto en plantas como en animales. Los cambios intragenómicos o las modificaciones postraduccionales en SCSV han disminuido la longitud de la secuencia, pero han aumentado el potencial antigénico y el número de regiones de unión antigénica en la superficie de la proteína. Hemos predicho los determinantes antigénicos responsables más probables y los aglutinantes del MHC dentro de los virus de la familia Nanoviridae. Las moléculas MHC juegan un papel crucial en la respuesta inmune del huésped. Los nonameros de los determinantes antigénicos en las proteínas de la cubierta viral de la familia Nanoviridae son altamente sensibles a las moléculas H-2Kd e I-Ag7. La especie dentro de géneros particulares muestra sus epítopos comunes junto con diversos epítopos colegas. Estos péptidos antigénicos comunes pueden usarse como sus identificadores. Estos identificadores, junto con sus diversos colegas, podrían ser más informativos para la producción de antídotos contra ellos mismos. Además, estos son importantes para la producción de vacunas de péptidos sintéticos contra los virus relevantes.