Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Proteómica muscular de la carpa mayor india Catla (Catla catla, Hamilton)

Bimal Prasanna Mohanty, Sudeshna Banerjee, Soma Bhattacharjee, Tandrima Mitra, Gopal Krishna Purohit, Anil Prakash Sharma, Dhanasekar Karunakaran y Sasmita Mohanty

Antecedentes: La proteómica del músculo esquelético tiene como objetivo la identificación global, la catalogación y la caracterización bioquímica de todo el complemento proteico de los tejidos contráctiles voluntarios . En los vertebrados inferiores como los peces, el músculo esquelético contribuye con el 34-48% del peso corporal total y la composición muscular contribuye en gran medida a la calidad. La caracterización del proteoma muscular es clave para muchos aspectos de la acuicultura, que abarcan la fisiología, el crecimiento, la seguridad alimentaria, la autenticación y calidad de los productos del mar, la trazabilidad y la vida útil. Catla catla es una especie de carpa de importancia comercial que contribuye en gran medida a la producción acuícola de agua dulce en el subcontinente indio; sin embargo, hay poca información ómica disponible sobre esta especie.

Métodos: En el presente estudio, las manchas de proteína extirpadas de geles bidimensionales del proteoma del músculo catla se identificaron mediante MALDI-TOF-MS. Con base en la información proteómica del músculo, se generó información de transcripción sobre las proteínas identificadas.

Resultados: Se generó un mapa de proteoma muscular de referencia para Catla catla y MALDI-TOF MS identificó 70 puntos de proteína de geles 2-D, que representan 22 proteínas. También hemos generado la información de la secuencia genética parcial de las proteínas identificadas que se han enviado a GenBank.

Conclusión: Este es el primer estudio sobre la proteogenómica muscular de la carpa Catla catla, de importancia comercial. Además de agregar a la base de conocimientos existente sobre proteómica muscular comparativa, la información generada también serviría como información proteogenómica de referencia sobre esta importante carpa india.