Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto
ISSN: 0974-276X
ISSN: 0974-276X
Quanwei Zhang, Xueying Wang, Jishang Gong, Youji Ma, Yong Zhang y Xingxu Zhao
La genética molecular de la búsqueda de un gen candidato sobre la adaptabilidad a las alturas y la resistencia al frío se ha convertido en un tema candente mundial en la biología de meseta, especialmente en humanos y yak. APEX1 como gen de referencia, desempeñando un papel crucial en la enzima de reparación por escisión de base (BER), las investigaciones sobre yak APEX1 pueden ayudar a comprender la adaptación de yak en la meseta y luego aumentar aún más su valor económico. Se clonó la secuencia de ADNc de longitud completa de la endonucleasa 1 apurínica/apirimidinicsite (APEX1) de yak blanco de Tianzhu para estudiar las funciones de APEX1 y sus mecanismos en la resistencia al estrés. Se usaron técnicas de PCR y RACE para obtener la longitud completa de la secuencia de ADNc de APEX1. El resultado indicó que el cDNA de longitud completa de yak APEX1 era de 1391 pb (número de acceso de GenBank KF611690), con un ORF de 957 pb que codificaba 318 aminoácidos. El análisis de la secuencia de aminoácidos indicó que APEX1 estaba altamente conservado en la mayoría de los mamíferos. El peso molecular previsto y el pI de yak APEX1 fueron 35,1 KDa y 7,82, respectivamente. Según el análisis del aminoácido APEX1 en el yak blanco de Tianzhu, APEX1 era un tipo de proteína hidrófila, pero no secretada y transmembrana. La estructura 3D predicha de APEX1 tiene pliegues y topología similares a los de APEX1 humano. Las expresiones relativas de APEX1 en el hígado, el corazón, los testículos, los ovarios, los pulmones, el cerebro, los músculos, el bazo y los riñones se detectaron mediante PCR cuantitativa en tiempo real, el resultado sugirió que el nivel más alto de expresión del ARNm de APEX1 de yak estaba en el cerebro y seguido de ovario, bazo y riñón.