Investigación inmunológica
Acceso abierto

abstracto

Análisis inmunoinformático del proteoma H5N1 para diseñar una vacuna derivada de un epítopo y predecir la prevalencia de inmunidad mediada por células preexistente frente al virus de la gripe aviar en la población de Indonesia

Marsia Gustiananda

Antecedentes La persistencia de la gripe A virus H5N1 entre las aves de corral en Indonesia, junto con un número creciente de infecciones humanas por este virus, apuntan al riesgo de un evento de reordenamiento con otros subtipos de influenza A prevalentes en Indonesia. En ausencia de anticuerpos de protección cruzada contra la cepa emergente, la presencia de inmunidad celular podría reducir la enfermedad gripal a un nivel subclínico y podría amortiguar la pandemia. Este estudio evaluó el grado de probable inmunidad mediada por células T de protección cruzada contra tales cepas emergentes hipotéticas de influenza A. Se evaluaron las 11 secuencias de proteínas de aislamientos de H5N1 de Indonesia para determinar la presencia de epítopos de células T restringidos por los tipos de HLA de Indonesia.
Resultados Entre 4433 posibles péptidos no nominadores, 225 fueron predichos como buenos epítopos CTL (puntuación < 1 %) por NetCTLpan y tenían una fuerte afinidad de unión (IC50 < 50 nM) hacia moléculas HLA por IEDBann y netMHCann. El análisis de conservación de epítopos reveló que al menos el 60 % de los aislados indonesios H5N1 contenían las secuencias idénticas de este conjunto de 225 péptidos. Sesenta y nueve péptidos fueron específicos para H5N1 y 156 tuvieron reactividad cruzada con otros subtipos. Números significativos (184) de péptidos unidos a más de un alelo HLA (promiscuo). El análisis Blast mostró que la mayoría (213) de los péptidos no tenían similitud con los péptidos propios humanos que probablemente inducirían la autoinmunidad si se usaban para la vacunación. Ciertos péptidos pueden actuar como un núcleo para moléculas HLA Clase II, y algunos se superponen con los epítopos de células B lineales putativos. Dieciocho péptidos surgieron como posibles componentes de la vacuna optimizados para una población de Indonesia, pero probablemente también sean efectivos entre la mayoría de los otros grupos étnicos.
Conclusiones La exposición rutinaria a la influenza A estacional probablemente asegura cierto nivel de inmunidad de protección cruzada contra el H5N1 y la mayoría de los mutantes de reordenamiento. La identificación de tales epítopos de células T con reacción cruzada probable puede ayudar a medir la amenaza de posibles brotes y a componer las vacunas que podrían contenerlos.