Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto
ISSN: 0974-276X
ISSN: 0974-276X
Ming Lu, Julian P. Whitelegge, Stephen A. Whelan, Jianbo He, Romaine E. Saxton, Kym F. Faull y Helena R. Chang
Se cree ampliamente que el descubrimiento de biomarcadores tumorales específicos, sensibles y fiables puede mejorar el tratamiento del cáncer. El objetivo de este estudio fue desarrollar un nuevo protocolo de fraccionamiento dirigido a proteínas hidrofóbicas como posibles biomarcadores de membrana de células cancerosas. Las proteínas hidrofóbicas de tejidos y líneas celulares de cáncer de mama se enriquecieron mediante columnas poliméricas de fase inversa. Las proteínas retenidas se eluyeron y digirieron para la identificación de péptidos mediante cromatografía de nanolíquidos con espectrometría de masas en tándem utilizando un Orbitrap de trampa de iones lineal híbrido. Se identificaron cientos de proteínas de cada una de estas tres muestras: tumores, tejido mamario normal y líneas celulares de cáncer de mama. Muchas de las proteínas identificadas definieron funciones celulares clave. Se examinaron y compararon sistemáticamente perfiles de proteínas de cáncer y tejidos normales del mismo paciente. Los marcadores de células madre se sobreexpresaron en cáncer de mama triple negativo (TNBC) en comparación con las muestras sin TNBC. Debido a que se sabe que las células madre del cáncer de mama son resistentes a la radiación y la quimioterapia, y pueden ser la fuente de metástasis que se observa con frecuencia en pacientes con TNBC, nuestro estudio puede proporcionar evidencia de moléculas que promueven la agresividad de TNBC. Los resultados iniciales obtenidos usando una combinación de fraccionamiento hidrofóbico y análisis de espectrometría de masas nano-LC de estas proteínas parecen prometedores en el descubrimiento de posibles biomarcadores de cáncer. Cuando se refina lo suficiente, este enfoque puede resultar útil para la detección temprana y un mejor tratamiento del cáncer de mama.