Virología y Micología
Acceso abierto

abstracto

Coronavirus respiratorios humanos detectados en pacientes con influenza- Como la enfermedad en Arkansas, EE. UU.

Camila S Silva,Lisa B Mullis,Olavo Pereira Jr,Linda J Saif,Anastasia Vlasova,Xuming Zhang,Randall J Owens,Dale Paulso,Deborah Taylor,Lia M Haynes,Marli P Azevedo

Los virus respiratorios agudos a menudo resultan en morbilidad y mortalidad significativas. El impacto potencial de las infecciones por coronavirus respiratorio humano (CoV) se subestimó hasta el brote del síndrome respiratorio agudo severo (SARSCoV) en 2003, que demostró que los nuevos coronavirus altamente patógenos podrían introducirse en los humanos, lo que destaca la importancia de monitorear los coronavirus circulantes. El uso de métodos moleculares sensibles ha contribuido al diagnóstico diferencial de los virus que circulan en humanos. El objetivo de nuestro estudio fue investigar la epidemiología molecular de las cepas de CoV humano que circulan en Arkansas, su variabilidad genética y su asociación con los síntomas similares a los de la influenza informados. Analizamos 200 muestras de hisopos nasales, recolectadas por el Departamento de Salud de Arkansas en 2010, para el diagnóstico de influenza. Todas las muestras procedían de pacientes que mostraban síntomas respiratorios agudos mientras daban negativo para la influenza. Las muestras se preseleccionaron utilizando una reacción en cadena de la polimerasa con transcriptasa inversa cuantitativa (qRT-PCR) multisonda para coronavirus, y se sometieron a pancoronavirus confirmatorio y/o transcriptasa inversa (RT)-PCR específica de cepa seguido de análisis de secuencia. Setenta y nueve muestras (39,5%) fueron positivas por qRTPCR y 35 muestras (17,5%) fueron confirmadas por RT-PCR convencional. Veintitrés de las muestras confirmadas (59%) fueron secuenciadas. La cepa detectada con mayor frecuencia fue similar a HCoV-OC43 seguida de similar a NL63; solo una muestra resultó positiva para HCoV-229E y otra para HCoV-HKU1. Se detectaron cepas de CoV de tipo felino en tres muestras, lo que representa una posible evidencia de transmisión entre especies o una nueva cepa humana. El diecisiete por ciento de las muestras positivas de coronavirus también dieron positivo para otros virus respiratorios, como el virus respiratorio sincitial (VSR), la parainfluenza 2 y 3 y el rinovirus. Por lo tanto, HCoV-OC43, NL63, HKU1 y nuevas cepas felinas estaban circulando en Arkansas en 2010. HCoV fue el único virus respiratorio detectado en el 16 % de los pacientes que mostraron síntomas respiratorios agudos con diagnóstico negativo para el virus de la influenza.