Revista de métodos de diagnóstico médico
Acceso abierto

abstracto

Evaluación de la integridad del ARN extraído por material de referencia de ARN

Junko Takahashi, Akiko Takatsu y Hitoshi Iwahashi

La información fisiológica que se identifica a partir del nivel de expresión de ARN en tejidos u órganos nos brinda beneficios en el diagnóstico clínico. Después de extraer el ARN de sangre, tejido u órganos, los diagnósticos se llevaron a cabo utilizando una técnica de estimación semicuantitativa de ARNm específico, como PCR en tiempo real o micromatrices de ADN. La validación de la calidad del ARN necesita una estimación cuantitativa de la expresión génica en el momento del muestreo, ya que el uso de ARN degradado conducirá a resultados incorrectos. En este estudio, llevamos a cabo una serie de experimentos para evaluar la integridad del ARN utilizando los materiales de referencia de longitud de ARN de 1000 pares de bases (refRNA1000) y en comparación con RIN. Existe una correlación significativa entre RIN y la cantidad de refRNA1000, en estado variable de degradación. También existen correlaciones significativas entre la cantidad de refRNA1000 y genes endógenos como Actb y Rps18 en diferentes estados de degradación en nuestro estudio. La cantidad de gen endógeno refleja la extensión de la degradación más directamente que la de RIN. Para controlar el alcance de la degradación desde el punto de partida experimental, podemos consultar los materiales de referencia de refRNA1000. No solo para el diagnóstico clínico, sino que los científicos siempre requieren la validez del procedimiento experimental, uno de los métodos candidatos es el uso de materiales de referencia de ARN como refRNA1000