Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Análisis in silico de secuencias de aminoácidos en relación con la especificidad y las propiedades fisicoquímicas de algunas nitrilasas microbianas

Nikhil Sharma, Rekha Kushwaha, J. S. Sodhi y T. C. Bhalla

Análisis in silico de secuencias de aminoácidos de algunas nitrilasas microbianas aromáticas y alifáticas para determinar ciertas propiedades fisicoquímicas y se ha realizado la especificidad para los nitrilos aromáticos o alifáticos. El análisis de alineación de secuencia múltiple de secuencias de aminoácidos ha mostrado diferencias claras entre las nitrilasas aromáticas y alifáticas en términos de presencia específica de posición de aminoácidos conservados. El análisis estadístico de la mayoría de los parámetros fisicoquímicos no mostró ninguna distinción clara entre las dos nitrilasas. En las nitrilasas aromáticas, los residuos de aminoácidos conservados además de la tríada del dominio del sitio activo (Glu, Lys, Cys) fueron His-129, Asn-168 y Arg-174 y estos fueron reemplazados por Arg-129, His -168 y Lys-174 en alifáticos. nitrilasas. Las propiedades fisicoquímicas de estos dos grupos de nitrilasas también diferían, p. En comparación con las nitrilasas alifáticas, las nitrilasas aromáticas tienen un número menor de residuos de aminoácidos, una masa molecular más baja, valores de pI más altos y un contenido más alto de residuos de Ala y Cys.