Revista de Horticultura
Acceso abierto

abstracto

Secuenciación del transcriptoma de novo de pasto azul de Kentucky tratado con frío (Poa pratensis) y análisis de los genes implicados en la tolerancia al frío

Zhang L, Ren J, Li T, Wang A y Tan D

El pasto azul de Kentucky (Poa pratensis) es muy resistente al estrés por frío. Aunque el mecanismo molecular de la respuesta de la planta al estrés por frío ha sido ampliamente documentado en plantas modelo, se sabe poco sobre la tolerancia al frío del pasto azul de Kentucky a nivel genómico. Aquí, comparamos los transcriptomas de Kentucky bluegrass bajo tratamiento en frío (-5 ° C) y un tratamiento de control (a 20 ° C) por RNA-seq y ensamblaje de novo. Se generaron un total de 75.934 unigenes, de los cuales 53.762 se anotaron con éxito en bases de datos públicas. Al comparar los transcriptomas de las plantas de control y tratadas con frío, se identificaron 3.896 unigenes expresados diferencialmente. Entre estos genes, 2410 estaban regulados negativamente y 1486 estaban regulados positivamente en las plantas tratadas con frío. Se identificaron algunas proteínas inducidas por frío, enzimas antioxidantes y proteínas de osmorregulación informadas anteriormente, y se estimaron sus niveles de expresión. Además, se seleccionaron diez genes expresados diferencialmente para la verificación de qRT-PCR. Sus patrones de expresión fueron consistentes con los resultados de RNA-seq. Además, las familias de factores de transcripción, es decir, factores de respuesta de etileno, factores de transcripción de estrés por calor, proteínas NAC, proteínas que contienen el dominio WRKY y factores de respuesta de auxina, se identificaron como genes expresados diferencialmente. La identificación de estos genes implicados facilitará los estudios sobre la regulación transcripcional de la tolerancia al frío en las plantas.