Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Modelado comparativo y análisis de la estructura tridimensional de EMV2, una proteína abundante en embriogénesis tardía de Vigna Radiata (Wilczek)

Subramanian Rajesh, Muthurajan Raveendran y Ayyanar Manickam

Las proteínas LEA son ubicuas entre los organismos fotosintéticos y se han informado en plantas mono y dicotiledóneas, así como en nematodos , levaduras, bacterias y cianobacterias. EMV2 es una proteína LEA del Grupo 1 aislada de Vigna radiata, que se especula que imparte tolerancia a la desecación en las plantas. El modelo de homología de esta proteína se generó utilizando el software LOOPP basado en los homólogos estructurales disponibles en las bases de datos de proteínas. El modelo final obtenido por el método de dinámica y mecánica molecular fue evaluado por PROCHECK que mostró que el modelo refinado final es confiable. El modelo podría resultar útil en una mayor caracterización funcional de esta proteína.