Transcriptómica: Acceso Abierto
Acceso abierto
ISSN: 2329-8936
ISSN: 2329-8936
Achilonu C Conrad y Maleka F Mathabatha
La calcona sintasa (CHS) y la antocianidina sintasa (ANS) se encuentran entre las enzimas clave responsables de la producción de antocianinas en las plantas . Por lo general, están codificados por familias multigénicas y algunos miembros de estas familias contribuyen a la pigmentación del color. El estudio examinó los genes CHS y ANS en Clivia miniata; cuyos tejidos florales sufren cambios de color. El ARN a ADNc se aisló de tejidos florales y se obtuvieron inicialmente tres unigene (s) (CmiCHS 11996, CmiCHS 43839 y CmiANS) de longitudes de secuencia cortas utilizando la técnica de secuenciación de próxima generación. Se diseñaron cebadores específicos de genes a partir de las secuencias cortas iniciales no publicadas de CHS y ANS. La longitud del ADNc amplificado después de la PCR fue CmiCHS 11996 (933 pb), CmiCHS 43839 (951 pb) y CmiANS (983 pb). El inicio del marco ORF traducido correspondiente a la proteína predicha de la proteína deducida de 390 aminoácidos (AEN04070) para los genes CHS, y predicho de 355 aminoácidos con respecto al gen ANS (AGD99672). El análisis in silico reveló que el peso molecular calculado y el punto isoeléctrico (pI) teórico CmiCHS 11996 y CmiCHS43839 eran 31,0 kDa - 6,95 y 34,6 kDa - 7,54 respectivamente. Los motivos importantes del sitio de unión al producto y el sitio activo se identificaron con éxito a partir de las secuencias de aminoácidos deducidas. El alineamiento de secuencias múltiples mostró que las secuencias de CmiCHS y CmiANS estaban muy conservadas y compartían una alta identidad de secuencia (>83%) con chalcona sintasas de otras plantas. Sin embargo, se realizó otro ensayo para determinar los perfiles de expresión de estos genes en diferentes tejidos así como en los tépalos (naranja y flor amarilla) mediante PCR cuantitativa en tiempo real. Los niveles de expresión de CmiCHS y CmiANS fueron mayores en tépalos en comparación con otros tejidos (hojas, estilo y estigma y escapo). Estos patrones de expresión de los genes en los tejidos correspondían a la acumulación de antocianina, lo que sugiere que los pigmentos de color naranja y amarillo ciertamente estaban relacionados con la regulación de la calcona sintasa y la antocianina sintasa.