Investigación inmunológica
Acceso abierto
ISSN: 1745-7580
ISSN: 1745-7580
Muthuraman Sathiamurthy, Bjoern Peters, Huynh-Hoa Bui, John Sidney, John Mokili, Stephen S Wilson, Ward Fleri, Deborah L McGuinness, Philip E Bourne y
Los epítopos se pueden definir como las estructuras moleculares unidas por receptores específicos, que se reconocen durante las respuestas inmunitarias. El proyecto de recursos de análisis y base de datos de epítopos inmunitarios (IEDB) catalogará y organizará la información sobre epítopos de anticuerpos y células T de patógenos infecciosos, antígenos experimentales y autoantígenos, con prioridad en los patógenos de categoría A-C del NIAID (http://www2.niaid. nih.gov/Biodefense/bandc_priority.htm) y enfermedades infecciosas emergentes/reemergentes. Se catalogarán características tanto estructurales como filogenéticas intrínsecas, así como información relativa a las interacciones de los epítopos con el sistema inmunitario del huésped. Descripción: Para representar y comunicar de manera efectiva la información relacionada con los epítopos inmunes, se desarrolló una ontología formal. La semántica del dominio del epítopo y los conceptos relacionados se capturaron como una jerarquía de clases, que representan las relaciones generales y especializadas entre los diversos conceptos. Puede encontrar una lista completa de las clases y sus propiedades en http://www.immuneepitope.org/ontology/index.html. Conclusión: la ontología de IEDB es la primera ontología diseñada específicamente para capturar información química y bioquímica intrínseca relacionada con epítopos inmunitarios con información relacionada con la interacción de estas estructuras con moléculas derivadas del sistema inmunitario del huésped. Anticipamos que el desarrollo de este tipo de ontología y bases de datos asociadas facilitará la descripción rigurosa de los datos relacionados con los epítopos inmunitarios y, en última instancia, podría dar lugar a métodos completamente nuevos para describir y modelar las respuestas inmunitarias.