Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto
ISSN: 0974-276X
ISSN: 0974-276X
Jubilee Purkayastha, Syed Imteyaz Alam, Nabonita Sengupta, Bikash Nath, Bhoj Kumar, Hemanta Kumar Gogoi, Lokendra Singh y Vijay Veer
Con el análisis proteómico que incluye 2-DE, análisis de imágenes e identificación de proteínas con MALDI-TOF/MS, se inició una investigación destinada a comprender mejor el proteoma de la fruta entera y las proteínas y/o productos génicos expresados diferencialmente. llevado a cabo con extractos de frutas totales de Bhut Jolokia (Capsicum assamicum) y menos picante Capsicum frutescens. Aquí se han identificado un total de 107 puntos de proteínas dominantes utilizando una técnica 2-DE/MS. Entre las proteínas identificadas, 14 proteínas exhibieron diferencia cualitativa con expresión única en Bhut Jolokia y 6 proteínas mostraron alteraciones de expresión diferencial cuantitativa. Entre las 6 proteínas diferenciales, una estaba regulada negativamente y 5 estaban reguladas positivamente. Aparte de las proteínas únicas y diferenciales para las que no se pudo asignar un grupo de grupos ortólogos (COG) (36,84 %), la mayoría de las proteínas únicas y diferencialmente expresadas dominantes se asignaron al COG de producción y conversión de energía (21,05 %) y también transporte y metabolismo de carbohidratos (21,05%). Esta expresión diferencial de proteínas se confirmó aún más para los candidatos seleccionados mediante RT PCR semicuantitativa y PCR cuantitativa en tiempo real. Esta es la primera descripción proteómica del chile más picante del mundo ‘Bhut Jolokia’ y un análisis funcional detallado de estas proteínas proporcionaría más información sobre los procesos celulares complejos y el mecanismo de acritud en esta importante fuente de capsaicinoides.