Virología y Micología
Acceso abierto
ISSN: 2161-0517
ISSN: 2161-0517
Vitaliy Strochkov, Yerbol Burashev, Nurlan Sandybayev, Gang Xie, Tracy H. Erkkila, Helen Cui, Jeanne M. Fair
Antecedentes: la notable diversidad y movilidad de los virus de la enfermedad de Newcastle (NDV) incluye virus virulentos de genotipo VI. Estos virus a menudo se denominan paramixovirus de paloma 1 porque normalmente se aíslan y causar enfermedad clínica en aves de la familia Columbidae. Los virus del genotipo VI ocasionalmente infectan y también pueden causar enfermedad clínica en las aves de corral. Por lo tanto, la evolución, la propagación actual y la detección de NDV son relevantes para las aves. salud.
Métodos: Se realizaron estudios de secuenciación de nucleótidos y filogenéticos de tres aislamientos de Kazajstán para caracterizar el gen de la proteína de fusión (F) completa, así como la secuencia del genoma completo. Los datos de la secuencia se compararon con 106 genes de fusión que representan diferentes genotipos y subgenotipos del NDV, así como 225 genes de fusión y 37 genoma completo de cepas de NDV de clase VI de diferentes regiones del mundo en diferentes períodos de tiempo. filogenético Se construyeron árboles para determinar las relaciones evolutivas entre estas cepas. Analizamos la proteína de fusión (F) Secuencias del gen y del genoma completo, incluido el sitio de escisión.
Resultados: el genoma completo de estos 3 aislamientos contenía 15142 pb, 15085 pb y 15102 pb de longitud, similar a las de las cepas del virus de la enfermedad de Newcastle (NDV) en los genotipos VIg, con el orden génico 3’-NP-P-M-F-HN-L-5’. El El sitio de escisión de la proteína de fusión fue 112KRQKR116-F117, una característica generalmente asociada con cepas virulentas de NDV. El análisis filogenético, basado en secuencias genómicas, SNP y secuencias de genes de fusión, reveló que tres aislamientos deben clasificarse como NDV de genotipo VIg de clase II. El análisis filogenético reveló que el NDV de varios sitios en Kazajstán era muy similar genéticamente y que se agrupaba junto con NDV de genotipo VIg. Basado en nuestro análisis de datos, los aislamientos de VIg compartieron la identidad de secuencia más alta con los aislamientos de Rusia y Ucrania de VIg subgenotipo, sugiere la posible propagación del NDV velogénico en esta región a través del comercio transfronterizo de aves vivas.
Conclusión: nuestro estudio proporciona información de referencia sobre las características genéticas del VEN que circula en Kazajistán y proponemos que el estudio evolutivo y epidemiológico del VEN virulento podría ayudar a proporcionar datos moleculares sobre las variantes que circulan en esta región, lo que ayuda en el diseño de recombinantes más eficientes vacunas.