Diario de Ensayos Clínicos
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abstracto

Validación de genes de referencia para el análisis de la expresión génica en el desarrollo de frutos de Vaccinium bracteatum Thunb mediante PCR cuantitativa en tiempo real

Feng He*, Liangxian Gui, Yan Zhang, Bo Zhu, Xiaoping Zhang, Min Shen, Fengying Wan, Lu Yang, Jiaxin Xiao*

Antecedentes: Vaccinium bracteatum Thunb. (VBT) está ampliamente distribuido en las zonas montañosas del este y sur de China. Las hojas de VBT tienen un gran valor médico y se pueden usar para teñir el arroz y producir "Wumifan". Sus frutos también contienen ricos nutrientes. Sin embargo, ha habido una atención limitada a la exploración del contenido molecular de VBT. Anteriormente, realizamos RNA-seq en tres frutas VBT típicas que se encontraban en varias etapas de maduración, aunque se perdió un gen de referencia confiable en la validación.

Resultados: En este estudio, seleccionamos diez genes de referencia candidatos basados en estudios previos y análisis transcriptómicos. Posteriormente, estos genes se evaluaron mediante una combinación de métodos, incluidos geNorm, NormFinder y Bestkeeper, con una evaluación de clasificación integral. Como resultado, encontramos que los genes actina2, NADH y ADK tienen una alta confiabilidad para analizar los niveles de expresión de los genes involucrados en el desarrollo de la fruta. Además, los niveles de transcripción de 15 DEG del análisis transcriptómico se evaluaron usando NADH como gen de referencia, y los datos de RT-qPCR fueron muy consistentes con los datos transcriptómicos.

Conclusiones: Estos resultados proporcionan un gen de referencia confiable para seguir estudiando la expresión génica, lo que será beneficioso para explorar exhaustivamente VBT.