Revista de Hematología y Enfermedades Tromboembólicas
Acceso abierto
ISSN: 2329-8790
ISSN: 2329-8790
Gadareth Higgs, Zhixiang Lin, Valeria Cento Valentina Svicher, Shilpa Hattangadi, Jing Zhang
Introducción: El virus de la hepatitis B (VHB) es muy común y ha sido difícil de tratar, principalmente debido a la alta tasa de mutación del gen de la polimerasa de su transcriptasa inversa. El objetivo de nuestro estudio fue utilizar estadísticas bayesianas para determinar las posiciones de las mutaciones dentro del genoma del VHB.
Material y métodos: Los datos de secuencia se derivaron de 73 tratamientos ingenuos y 215 tratamientos fallidos, de varios medicamentos, a partir de datos de pacientes proporcionados por colaboradores de la Universidad de Tor Vergata. Se aplicó el algoritmo Metropolis-Hastings a los datos para determinar las ubicaciones de mutación que se correlacionan con la resistencia a los medicamentos.
Resultados: Para las posiciones de aminoácidos 80-250, se demostró que diecinueve posiciones habían mutado en el grupo de fracaso del tratamiento. Quince de las diecinueve posiciones estaban en el genotipo D del VHB, mientras que las otras cuatro estaban dentro del genotipo A proveniente del fármaco lamivudina (LMV). Para las posiciones de aminoácidos 250-344, se mutaron dieciséis posiciones con siete de las dieciséis originadas en LMV en el genotipo D. Cuatro mutaciones se originaron a partir de LMV en el genotipo A.
Conclusión: esta investigación identificó posiciones de mutación previamente desconocidas y posiciones confirmadas identificadas en investigaciones anteriores. Colaboradores de la Universidad de Roma, Tor Vergata, han validado las posiciones mutadas de forma experimental con un 454-pirosecuenciador. Se espera que el conocimiento de estas mutaciones conduzca a mejores opciones de tratamiento. Además, con una mayor disponibilidad de datos genómicos, se pueden realizar investigaciones futuras en un conjunto de datos de VHB más grande y para otras enfermedades.