Ginecología y Obstetricia
Acceso abierto

abstracto

Uso de perfiles de ARNm en sangre para identificar biomarcadores para la detección del cáncer de ovario

Samuel C Mok, Jae-Hoon Kim, Steven J Skates, John O Schorge, Daniel W Cramer, Karen H Lu, Choong-Chin Liew

Propósito: Identificar firmas genómicas candidatas para la detección temprana de cáncer de ovario utilizando perfiles de expresión génica basados en sangre total.

Diseño experimental: Realizamos análisis de micromatrices Affymetrix U133Plus 2.0 GeneChip en muestras de ARN de sangre total obtenidas de 14 pacientes con cáncer de ovario y 15 mujeres sanas de la misma edad. Los genes expresados diferencialmente se identificaron usando una prueba t de Welch paramétrica. Se realizaron análisis de qRT-PCR en tiempo real en ARN preparado a partir de 96 pacientes con cáncer de ovario y 83 mujeres sanas de la misma edad, utilizando conjuntos de cebadores específicos para 14 genes. Una prueba U de Mann Whitney evaluó la importancia de los genes individuales. Los niveles de CA125 se determinaron en el mismo conjunto de muestras. Utilizamos análisis de regresión logística y validación cruzada para evaluar la capacidad de las combinaciones lineales de transcritos específicos combinados con CA125 para distinguir el cáncer de los controles.

Resultados: los análisis de micromatrices mostraron que 9583 sondas eran significativamente diferentes en los perfiles de expresión génica en sangre de mujeres sanas en comparación con las de pacientes con cáncer de ovario (p<0,05). Los análisis de RT-PCR en tiempo real en los 96 casos y 83 controles validaron 7 genes, que mostraron niveles de expresión significativamente diferentes en casos y controles. Los análisis de regresión logística y la validación cruzada identificaron un panel óptimo de marcadores, incluidos CA125, BRCA1 y KIAA0562, que podrían mejorar la sensibilidad de CA125 solo a más del 90 % con una especificidad del 98 % en la detección del cáncer de ovario en etapa temprana.

Conclusión: Los perfiles de expresión génica en sangre circulante identificaron marcadores de ARN que pueden mejorar la sensibilidad de CA125 en la detección del cáncer de ovario en etapa temprana. Se justifica una validación adicional para confirmar la utilidad clínica de estos biomarcadores.