Revista de química física y biofísica
Acceso abierto

abstracto

Residuos de triptófano de la ranura de unión de la tapa en los miembros de la familia eIF4E: sus contribuciones a los espectros de dicroísmo circular de UV cercano

Joanna Zuberek* y Agnieszka Stelmachowska

eIF4E, un factor clave en el inicio de la traducción dependiente de la tapa, se une a la estructura de la tapa en el 5’ extremo del ARNm por interacción de apilamiento que implica dos de sus ocho residuos de triptófano conservados. En este artículo, examinamos las contribuciones individuales de los residuos de triptófano a los espectros de dicroísmo circular de UV cercano para identificar similitudes y diferencias estructurales en el motivo de unión de la tapa entre los miembros de la familia eIF4E. El espectro CD de UV cercano de eIF4E1a humano en su forma apo, resultante principalmente de la transición de 1 Lb y dominado por dos bandas vibriónicas, se conserva entre eIF4E. Con base en la comparación de los espectros de CD para mutantes eIF4E, mostramos que los triptófanos involucrados en la interacción de apilamiento brindan contribuciones individuales más fuertes, lo que permite identificar su orientación diferente con respecto a la tapa. Esto indica que la CD de UV cercano es una herramienta rápida y poderosa para analizar la conformación del triptófano en las proteínas eIF4E y sus cambios al unirse a los análogos de cap modificados.