Genómica y biología fúngica
Acceso abierto

abstracto

Análisis transcriptómico de zonas de colonias de la cepa ΔflbA de Aspergillus niger

Pauline Krijgsheld y Han AB Wösten

Las colonias de tipo salvaje de Aspergillus niger crecen y secretan enzimas en su periferia cuando se cultivan en un medio de agar. La inactivación del gen de esporulación flbA da como resultado colonias que no solo secretan proteínas en su periferia, sino también en zonas centrales. Esto va acompañado de un secretoma más complejo, crecimiento en todo el micelio y paredes celulares más delgadas. Aquí, la expresión génica se estudió en la periferia, una zona intermedia y el centro de las colonias de tipo salvaje y ΔflbA utilizando micromatrices de genoma completo. La heterogeneidad en la expresión génica no se redujo en las colonias ΔflbA en comparación con las colonias de tipo salvaje, a pesar de la disminución de la heterogeneidad en la secreción zonal, la esporulación y el crecimiento. Se demostró que 1152 genes tenían una diferencia de cambio de veces en la expresión ≥ 2, cuando los perfiles de expresión promediados de las zonas del tipo salvaje se compararon con los de las colonias ΔflbA. Este conjunto de genes contenía 13 genes que se predijo que estarían involucrados en la reproducción, 12 genes involucrados en la biosíntesis, modificación y degradación de la pared celular, 345 genes que codifican proteínas secretadas y 38 genes que codifican reguladores transcripcionales. Estos genes pueden explicar las diferencias entre las colonias de tipo salvaje y ΔflbA en el crecimiento zonal, la esporulación y la secreción, y la complejidad del secretoma y el grosor de la pared celular. El conjunto de genes expresados diferencialmente, en particular, los genes que codifican los reguladores transcripcionales, puede ser fundamental para mejorar Aspergillus niger como factoría celular para la producción de enzimas.