Transcriptómica: Acceso Abierto
Acceso abierto
ISSN: 2329-8936
ISSN: 2329-8936
Kazue L. Ishihara, Michael D. H. Honda, Dung T. Pham, Dulal Borthakur
Leucaena leucocephala (leucaena) es una leguminosa arbórea de rápido crecimiento altamente tolerante a diversos estreses abióticos y bióticos. Debido a su capacidad para soportar altas temperaturas y sequías prolongadas y para crecer como una planta libre de enfermedades, es una planta modelo interesante para investigar la genética de la resistencia al estrés. El alto nivel de resistencia al estrés puede estar correlacionado con una mayor expresión de ciertos genes en la raíz, que es el sitio principal para la absorción de nutrientes y agua y también para la infección por patógenos transmitidos por el suelo. Los objetivos de este estudio fueron caracterizar el transcriptoma de la leucaena e identificar genes específicos de la raíz que puedan estar involucrados en la tolerancia a la sequía y la resistencia a enfermedades. Los transcriptomas de leucaena se analizaron mediante secuenciación basada en Illumina y ensamblaje de novo, lo que generó 62 299 y 61 591 unigenes (≥ 500 pb) de la raíz y el brote, respectivamente. A través de un análisis de microarrays de 4 x 180 000, se comparó la expresión de 10 435 unigenes entre la raíz y el brote. Las secuencias reguladas al alza en la raíz estaban representadas principalmente por unigenes que estaban relacionados con el metabolismo secundario, mientras que en el brote, las secuencias reguladas al alza estaban representadas principalmente por unigenes que estaban involucrados en el metabolismo de carbohidratos y lípidos. Los unígenos que comparten homología con genes de biosíntesis de terpenoides y un gen de nicotianamina sintasa se regularon al alza más de 100 veces en la raíz, lo que indica que estos genes pueden tener funciones importantes en la tolerancia al estrés de la leucaena. La catalogación de secuencias transcritas activamente en la raíz y el brote conducirá a la identificación de genes para la tolerancia a la sequía y la resistencia a enfermedades en la leucaena.