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ToxDelta: un nuevo programa para evaluar cómo la disimilitud afecta el efecto de las sustancias químicas

Azadi Golbamaki, Alessio M. Franchi, Serena Manganelli, Alberto Manganaro, Giuseppina Gini y Emilio Benfenati

ToxDelta es una nueva herramienta para la evaluación de la toxicidad de los productos químicos basada en una versión modificada del paquete fmcs_R. Dos moléculas estructuralmente similares comparten una subestructura común máxima (MCS). Para evaluar si dos moléculas similares tienen efectos diferentes, enfocamos nuestra atención en los fragmentos moleculares que no están en el MCS. Estas partes pueden aumentar o disminuir el valor de la propiedad. Consideramos una variación del concepto MCS de relevancia eficiente en la evaluación de la toxicidad donde los anillos de las moléculas no deben romperse. Para evaluar la toxicidad de la sustancia química objetivo, ToxDelta extrae el MCS y delinea los fragmentos restantes. Cada uno de estos restos representa una diferencia entre dos moléculas y su relevancia en la evaluación de la toxicidad se evalúa frente a una lista de fragmentos activos e inactivos basada en el conocimiento. ToxDelta considera las diferencias de las moléculas en un enfoque de lectura cruzada.