Revista de Glicobiología
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abstracto

Hacia la glucoinformática integradora para la investigación y el descubrimiento del cáncer con biomarcadores basados en glicanos

Sandra V Bennun, Deniz Baycin Hizal, René; Ranzinger y Michael J Betenbaugh

A pesar de algunos éxitos recientes en el descifrado de nuevos marcadores moleculares del cáncer, todavía existe una necesidad clara y continua de desarrollar nuevas tecnologías que ayuden a caracterizar los biomarcadores existentes o faciliten el descubrimiento de nuevos biomarcadores. Una oportunidad importante para la biología de sistemas a este respecto la proporciona la comprensión de los cambios de glicosilación asociados con el cáncer. De hecho, el interés en la glicosilación del cáncer se ha expandido durante la última década y se ha acumulado rápidamente una gran cantidad de datos relevantes para la glicosilación del cáncer. Además, las herramientas, métodos y bases de datos de glicoinformática sofisticados nuevos y mejorados para el análisis de glucanos ahora ofrecen la oportunidad de investigar estos datos para comprender el papel que desempeñan los glucanos en la glicosilación del cáncer. Aquí resumimos los desarrollos de las herramientas de glicoinformática para respaldar el análisis de la glicosilación del cáncer y los enfoques de glicoproteómica experimental. Además, discutimos los desafíos que enfrenta la glicoinformática para la integración y el interrogatorio de conjuntos de datos dispares de glicanos de alto rendimiento para asimilar tecnologías y abordar mejor la glicosilación del cáncer. También proporcionamos ejemplos de enfoques de glicoinformática integradora que conducen a una mejor comprensión de la glicosilación del cáncer como un proceso celular complejo.