Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Expresión de proteínas específicas de tejido en células, tejidos y órganos humanos

Marcus Gry, Per Oksvold, Fredrik Pontén y Mathias Uhlén

Una parte importante de la comprensión de la biología humana es el estudio de la expresión específica de tejido tanto a nivel de genes como de proteínas. En este estudio, el análisis de la expresión de proteínas específicas de tejido se realizó en base a datos de micromatrices de tejidos disponibles en la base de datos pública Human Protein Atlas (www.proteinatlas.org). Se llevó a cabo un análisis de proteínas humanas, correspondiente a aproximadamente un tercio de los genes que codifican proteínas, en 65 tejidos y tipos de células humanos. La distribución espacial y la abundancia relativa de 6.678 proteínas humanas se analizaron en diferentes poblaciones celulares de varios órganos y tejidos del cuerpo humano utilizando métodos no supervisados, como el agrupamiento jerárquico y el análisis de componentes principales, así como también con métodos supervisados (Breiman, 2001). . Se identificaron como específicos de tejido marcadores conocidos, como la neuromodulina para el sistema nervioso central, la queratina 20 para el tracto gastrointestinal y CD45 para las células hematopoyéticas. Se identificaron proteínas expresadas de manera específica de tejido para células en todos los tejidos investigados, incluidos el sistema nervioso central, el sistema hematopoyético, el epitelio escamoso, las células mesenquimales y las células del tracto gastrointestinal. Se identificaron varias proteínas que aún no están asociadas con la especificidad de tejido, lo que proporciona puntos de partida para futuros estudios para explorar funciones específicas de tejido. Esto incluye proteínas sin función conocida, como ZNF509 expresada en el SNC y C1orf201 expresada en el tracto gastrointestinal. En general, la mayoría de los productos génicos se expresan de manera ubicua y pocas proteínas se detectan exclusivamente en células de una clase de tejido en particular, como lo demuestra menos del 1 % de las proteínas analizadas que se encuentran solo en el cerebro.