Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

El uso de hisopado conjuntival para la caracterización proteómica del síndrome del ojo seco

Joanna Graham, Robert L.J. Graham, Raymond Beirne, Victoria E. McGilligan, Stephen C. Downes, Jonathan E. Moore, Tara C. B. Moore y Geoff McMullan

En este estudio informamos el primer análisis proteómico basado en gel de un ojo seco inflamado utilizando un método no invasivo basado clínicamente. metodología para la recolección de una muestra del párpado posterior y la mucosa conjuntival inferior del sujeto. Esta técnica multidimensional permitió la identificación de 592 proteínas, con un puntaje MOWSE superior a 40, utilizando la herramienta heurística PROVALT. La curación automatizada de esta lista utilizando una herramienta de búsqueda de base de datos aleatoria incorporada con una tasa de descubrimiento falso establecida en 1% redujo significativamente esta lista a 86 proteínas. La curación manual adicional dio como resultado la identificación positiva final de 75 proteínas. Estas proteínas identificadas se clasificaron funcionalmente y se caracterizaron fisicoquímicamente. Esto condujo a la identificación de una serie de proteínas implicadas en la estructura celular, la inflamación y la respuesta inmunitaria innata. Dentro de estas proteínas había una serie de posibles biomarcadores no solo del síndrome del ojo seco, sino también de la función de las células acinares de las glándulas lagrimales, como lacritina, calgranulina A y la proteína 4 rica en prolina lagrimal.