Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

El perfil proteómico de las líneas celulares de cáncer de páncreas correspondientes a la carcinogénesis y la metástasis

Masayo Yamada, Kiyonaga Fujii, Koji Koyama, Setsuo Hirohashi y Tadashi Kondo

Para investigar los antecedentes proteómicos de la carcinogénesis y la progresión del cáncer de páncreas, los perfiles de expresión de proteínas de nueve células pancreáticas bien caracterizadas líneas celulares de adenocarcinoma, cuyo potencial metastásico se examinó previamente en un modelo de xenoinjerto de ratón, y se examinaron dos líneas celulares inmortalizadas del conducto pancreático. La electroforesis en gel de diferencia bidimensional (2D-DIGE) identificó 126 puntos de proteína cuya intensidad era significativamente diferente entre las líneas celulares del conducto pancreático normal y las líneas celulares de cáncer de páncreas con diferente potencial metastásico. La identificación de proteínas por espectrometría de masas demostró que estas manchas de proteínas correspondían a 95 genes únicos, que incluían proteínas que no se habían mostrado previamente anómalas en el cáncer de páncreas. Para caracterizar el proteoma observado, LC-MS/MS identificó las proteínas correspondientes a los 1101 puntos de proteína detectados por 2D-DIGE. Las proteínas con la puntuación más alta para los 1101 puntos de proteína correspondieron a 459 proteínas únicas. 561 puntos de proteína única incluían múltiples proteínas, y 213 proteínas únicas se detectaron repetidamente como proteínas con la puntuación más alta en múltiples puntos de proteína. Estos resultados indican que 2D-DIGE captura un amplio espectro del proteoma y tiene el potencial de detectar las proteínas asociadas con la carcinogénesis y la progresión del cáncer de páncreas. Los datos de expresión e identificación de proteínas obtenidos se han incluido en nuestra base de datos pública, Genome Medicine Database of Japan Proteomics.