Revista internacional de minería de datos biomédicos
Acceso abierto
ISSN: 2090-4924
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Malin L Nording
Perfilar la oxilipina y el lipidoma endocannabinoide requiere estrategias profundamente sensibles, exactas y vigorosas, que pueden acomodarse mediante la utilización de cromatografía de fluidos (LC) junto con espectrometría de masas de pareja.(MS/MS) técnicas. Hemos construido algunas convenciones LC-MS/MS para estos lípidos bioactivos a partir de varios precursores de grasas insaturadas, básicamente ácidos araquidónicos y linoleicos, pero también a partir de ácidos eicosapentaenoicos y docosahexaenoicos, así como de otras grasas insaturadas. Originalmente, utilizábamos convenciones de extracción separadas para cada grupo de lípidos bioactivos (oxilipinas y endocannabinoides, individualmente) y, además, extraordinarios suministros de LC-MS/MS. Sea como fuere, para su aplicación en investigaciones clínicas, cada vez es más útil consolidar la metodología expositiva de oxilipinas y endocannabinoides para cubrir un segmento más grande del lipidoma en una sola infusión de LC-MS/MS y la extracción de prueba anterior. Tomaría en consideración volúmenes de ejemplo más pequeños y métodos de trabajo menos serios. Sea como fuere, el examen conjunto de oxilipinas y endocannabinoides es una tarea difícil, en parte debido a los diversos modos utilizados para la ionización ideal, negativo para las oxilipinas y positivo para los endocannabinoides. Además, los solventes de extracción, las etapas versátiles, etc., no son indistinguibles, por lo que los ajustes de las convenciones pasadas (independientes) fueron importantes. Retrataré nuestro trabajo hacia la consolidacióninvestigación de oxilipinas y endocannabinoides, que ahora hemos establecido en el Centro Sueco de Metabolómica en Umeå. Se presentarán los pasos cruciales en el proceso de trabajo y se darán instancias de aplicaciones exitosas.
La dieta y el sustento asumen un papel crítico en la ciencia de los lípidos bioactivos, ya que las criaturas bien evolucionadas se quedan cortas en la colección enzimática para incorporar los antecedentes de estas partículas mensajeras de forma endógena; ver más abajo para más detalles sobre las vías biosintéticas). Los lípidos bioactivos actúan principalmente a través de receptores acoplados a proteína G (GPCR, por ejemplo, el receptor de prostaglandina E (calidad PTGER1, receptor EP1)) o receptor atómico (NR) oficial (por ejemplo, PPARG), sin embargo, se han descrito otros sistemas de transducción de señales. , por ejemplo, la pauta de acción del canal de partículas. La promulgación de varias vías de señalización y átomos administrativos aguas abajo de sus receptores puede dar lugar a la pauta de una amplia gama de vías de señalización aguas abajo, incluidos los GPCR de las estructuras Gi, Gq y G12/13. fosfoinositida 3-quinasa (PI3K)- a Akt/proteína quinasa B (PKB), Ras/Raf-MEK-ERK, fosfolipasa C (PLC) a proteína quinasa C (PKC), Wnt/glucógeno sintasa quinasa-3β (GSK- 3β), Janus quinasa (Jak)/transductor de señal y activador del registro 3 (Stat3), factor atómico-κB (NF-κB) e interleucina-4 (IL-4) marcado. En el marco cardiovascular, los lípidos bioactivos se involucran con numerosas funciones diferentes, que incluyen cambios cardiovasculares, recuperación cardíaca, agravamiento, coagulación sanguínea, porosidad de las venas, angiogénesis, control del tono vascular y movimiento y unión celular. También asumen un papel fundamental en las diferentes capacidades fisiológicas y los estados neuróticos de otras enfermedades humanas, como la obesidad, el empeoramiento, la diabetes y la malignidad. Wnt/glucógeno sintasa quinasa-3β (GSK-3β), Janus quinasa (Jak)/transductor de señal y activador del registro 3 (Stat3), factor atómico-κB (NF-κB) e interleucina-4 (IL-4) marcado . En el marco cardiovascular, los lípidos bioactivos se involucran con numerosas funciones diferentes, que incluyen cambios cardiovasculares, recuperación cardíaca, agravamiento, coagulación sanguínea, porosidad de las venas, angiogénesis, control del tono vascular y movimiento y unión celular. También asumen un papel fundamental en las diferentes capacidades fisiológicas y los estados neuróticos de otras enfermedades humanas, como la obesidad, el empeoramiento, la diabetes y la malignidad. Wnt/glucógeno sintasa quinasa-3β (GSK-3β), Janus quinasa (Jak)/transductor de señal y activador del registro 3 (Stat3), factor atómico-κB (NF-κB) e interleucina-4 (IL-4) marcado . En el marco cardiovascular, los lípidos bioactivos se involucran con numerosas funciones diferentes, que incluyen cambios cardiovasculares, recuperación cardíaca, agravamiento, coagulación sanguínea, porosidad de las venas, angiogénesis, control del tono vascular y movimiento y unión celular. También asumen un papel fundamental en las diferentes capacidades fisiológicas y los estados neuróticos de otras enfermedades humanas, como la obesidad, el empeoramiento, la diabetes y la malignidad. Los lípidos bioactivos están involucrados con numerosas funciones diferentes, que incluyen eventos cardiovasculares, recuperación del corazón, agravamiento, coagulación sanguínea, porosidad de las venas, angiogénesis, control del tono vascular y movimiento y unión celular. También asumen un papel fundamental en las diferentes capacidades fisiológicas y los estados neuróticos de otras enfermedades humanas, como la obesidad, el empeoramiento, la diabetes y la malignidad. Los lípidos bioactivos están involucrados con numerosas funciones diferentes, que incluyen eventos cardiovasculares, recuperación del corazón, agravamiento, coagulación sanguínea, porosidad de las venas, angiogénesis, control del tono vascular y movimiento y unión celular. También asumen un papel básico en las diferentes capacidades fisiológicas y los estados neuróticos de otras enfermedades humanas, como la obesidad, el empeoramiento, la diabetes y la malignidad.
Algunas concentraciones significativas de lípidos bioactivos, como oxilipinas, nutrientes lipofílicos y análogos de brebajes derivados de plantas, se consideran valiosos para la salud humana y, por lo tanto, generalmente se los reconoce como agentes restauradores para contrarrestar y tratar enfermedades. Sea como fuere, estas percepciones son a menudo observacionales, y no se puede acceder a ningún método de razonamiento o comprensión irreflexiva, lo que tiene la importancia de llenar el vacío actual de información en este campo de estudio. Hay pruebas suficientes de que los lisofosfolípidos son imprescindibles para garantizar el desarrollo normal del corazón, especialmente la esfingosina-1-fosfato. S1P se une explícitamente a los receptores S1P para administrar capacidades novedosas en la mejora del corazón y la mandíbula inferior en el pez cebra. Se acaba de demostrar que el receptor S1P 2 controla el movimiento de los antecedentes de las células cardíacas en el organismo subdesarrollado del pez cebra, pero los efectos del receptor S1P 1 en el crecimiento son cada vez más dudosos. Algunos estudios muestran que la eliminación de la calidad s1pr1 intervenida por morfolino da como resultado un crecimiento excesivo de las venas y la disposición de las ramas ectópicas de los vasos, lo que sugiere que este receptor es capaz de equilibrar la vasculatura en formación en el pez cebra. Sea como fuere, la nucleasa efectora similar a un activador registrado (TALEN) intercedió la eliminación de la articulación s1pr1 no provoca ninguna deformidad formativa, y estos peces efectivamente se convierten en adultos. Estas inconsistencias lógicas obvias pueden aclararse hasta cierto punto mediante un informe en curso que recomienda que las transformaciones de knockout dañinas, pero no caídas intercedidas por morfolino, inician reacciones compensatorias en el giro vascular de los eventos del pez cebra. Asimismo, algunos receptores S1P pueden tener capacidades repetitivas en la disposición de las venas. La eliminación de s1pr1 intercedida por morfolino solo provoca cierto nivel de imperfecciones vasculares, pero la eliminación de s1pr1 y s1pr2 provoca graves insuficiencias de crecimiento vascular. Esta información sugiere que después de la pérdida de una isoforma del receptor S1P, otros receptores pueden compensar para garantizar que la vasculatura crezca regularmente. Sorprendentemente, otro examen en curso muestra que la sobreexpresión del receptor S1P puede afectar de manera efectiva al pez cebra. La eliminación de s1pr1 intercedida por morfolino solo provoca cierto nivel de imperfecciones vasculares, pero la eliminación de s1pr1 y s1pr2 provoca graves insuficiencias de crecimiento vascular. Esta información sugiere que después de la pérdida de una isoforma del receptor S1P, otros receptores pueden compensar para garantizar que la vasculatura crezca regularmente. Sorprendentemente, otro examen en curso muestra que la sobreexpresión del receptor S1P puede afectar de manera efectiva al pez cebra. La eliminación de s1pr1 intercedida por morfolino solo provoca cierto nivel de imperfecciones vasculares, pero la eliminación de s1pr1 y s1pr2 provoca graves insuficiencias de crecimiento vascular. Esta información sugiere que después de la pérdida de una isoforma del receptor S1P, otros receptores pueden compensar para garantizar que la vasculatura crezca regularmente. Sorprendentemente, otro examen en curso muestra que la sobreexpresión del receptor S1P puede afectar de manera efectiva al pez cebra.
Los niveles de s1pr1 generalmente son sofocados por el microARN (miR)-19a, y cuando los niveles de este microARN disminuyen, la articulación más alta de s1pr1 causa un círculo cardiovascular debilitado, formas irregulares de las cámaras y una regulación a la baja de las cualidades precursoras del corazón. La regulación al alza de s1pr1 parece intervenir en las consecuencias inconvenientes para la mejora del corazón y la hoja provocadas regularmente por el consumo del factor de registro 5 de T-box ((Tbx5) y el consiguiente consumo de miR-19a). En ratones, la situación parece, según todos los informes, mucho menos compleja, como lo muestra un informe en curso que utilizó la desactivación restrictiva del receptor S1P 1 mediada por Cre para crear organismos incipientes.
Este golpe de gracia causó falta de compactación ventricular, imperfecciones del tabique ventricular, anticipación de la extensión típica de los cardiomiocitos y letalidad perinatal, lo que demuestra que la articulación S1pr1 es vital para la mejora cardiovascular normal en ratones. También debe tenerse en cuenta que S1P tiene un fenotipo formativo in vitro. Un informe en curso usó microorganismos inmaduros pluripotentes incitados (iPSC) para mostrar que S1P podría mejorar su separación a cardiomiocitos cuando se administra en una fase inicial del procedimiento y podría desarrollar la expansión de CM cuando se dirige a una etapa posterior.
Estos impactos también se imitan cuando las iPSC se tratan con corrosivo lisofosfatídico, probablemente a través de la regulación de las vías de señalización estándar de Wnt/β-catenina y ERK]; consulte la Figura 3 para obtener una aclaración progresivamente definida de los impactos de S1P y LPA en las iPSC). Sin duda, el marcado de LPA se ha visto envuelto en la disposición de pivote de pez cebra durante el movimiento del cuerpo y, además, controla los círculos legítimos del corazón y la articulación gradual de las cualidades anteriores en el corazón.