Revista de química física y biofísica
Acceso abierto

abstracto

Técnicas FTIR de superficie para analizar la conformación de proteínas/péptidos en un entorno de H2O

Joseph D Combs, Cuauhtémoc U González y Chengshan Wang

Las proteínas/péptidos, que participan en varios procesos bioquímicos en sistemas biológicos, contienen vibraciones activas infrarrojas (IR). Entre todas las bandas de absorción de IR de proteínas/péptidos, la banda de amida I surge principalmente de la vibración de estiramiento de los carbonilos (C=O) en los enlaces de amida de la columna vertebral y es sensible a las conformaciones (como α– hélice, β–hoja, conformación no estructurada, etc.) en una proteína/péptido. Por lo tanto, la banda de amida I se ha utilizado para monitorear el comportamiento biofísico/bioquímico de proteínas/péptidos en muestras biológicas (p. ej., células o tejidos vivos). Sin embargo, la obtención de espectros IR reproducibles de proteínas/péptidos en solución de H2O fue un desafío mediante la medición de transmisión directa utilizando una celda líquida con una longitud de paso de nivel milimétrico, debido a la absorción IR intensiva de H2O alrededor de 1620 cm-1 que se superpone a la banda de amida I. . Por lo tanto, muchos de los espectros IR de proteínas/péptidos se lograron en D2O, que tiene una absorción IR de alrededor de 1200 cm-1. Dado que el D2O puede no ser un solvente favorable para las muestras biológicas, se necesitaba la posición de la banda de amida I de varias conformaciones como referencia para las muestras biológicas. En consecuencia, se han desarrollado varias técnicas FTIR de superficie (como la espectroscopia de absorción y reflexión infrarroja o IRRAS y la reflexión total atenuada o ATR) para obtener los espectros IR de proteínas/péptidos en un entorno de H2O y se han revisado aquí.