Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Sugerencia para actualizar el concepto canónico de traducción

Jan Charles Biró

Antecedentes: esta investigación se llevó a cabo para proporcionar un resumen de una serie de observaciones bioinformáticas entre 2000 y 2014 sobre la estructura de los ácidos nucleicos y los codones, la interacción entre los codones y los aminoácidos -ácidos y el concepto general de traducción.

Métodos: durante estos estudios se utilizaron bases de datos públicas de secuencias y estructuras y métodos establecidos de recursos bioinformáticos.

Resultados: estos estudios proporcionaron conocimientos novedosos sobre el concepto canónico de traducción y sugieren que: 1) los codones tienen una estructura y el desarrollo y la función de los residuos del codón 1, 2 y 3 son diferentes; 2) los límites de los codones están definidos fisicoquímicamente; 3) existe una compatibilidad estereoquímica (ajuste) entre los codones y los aminoácidos codificados; 4) la redundancia de codones en el Código Genético (codones sinónimos) proporciona información de plegamiento (3D) a la síntesis de proteínas, que es adicional a la información solicitada para determinar la secuencia de aminoácidos (estructura primaria o 2D); 5) hay un Código Proteómico en el Código Genético redundante; 6) los ARNm ayudan al plegamiento cotraduccional de sus propios péptidos codificados, es decir, funcionan como acompañantes de ácidos nucleicos; 7) Los tRNA ayudan incluso a la transferencia de información de plegamiento del mRNA a las proteínas (ciclo del tRNA), además de su papel tradicional como adaptador entre codones y aminoácidos.

Conclusiones: Los estudios computacionales (estadísticos), el modelado molecular y las consideraciones biológicas teóricas sugieren la posibilidad y la necesidad de actualizar el concepto canónico de traducción. Se solicita confirmación de laboratorio tradicional.