Avances en Ingeniería Genética
Acceso abierto

abstracto

Creación de subtipos de gliomas mediante la combinación de datos de expresión génica y CNV basados en un enfoque de detección compresiva

Wenlong Tang, Hongbao Cao, Ji-Gang Zhang, Junbo Duan, Dongdong Lin y Yu-Ping Wang

Se sabe que un análisis combinado de diferentes tipos de mediciones genómicas tiende a dar más
resultados de clasificación fiables. Sin embargo, cómo combinar de manera eficiente datos con diferentes resoluciones es un desafío. Proponemos un nuevo enfoque basado en la detección comprimida para el análisis combinado de datos de variantes de expresión génica y número de copias con el fin de subtipificar seis tipos de gliomas. Los resultados experimentales muestran que el enfoque combinado propuesto puede mejorar sustancialmente la precisión de la clasificación en comparación con el uso de cualquiera de los tipo de datos. El enfoque propuesto puede aplicarse a muchos otros tipos de datos genómicos.