Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Estandarización de datos de proteómica: el trabajo de la Iniciativa de estándares de proteómica de HUPO

Sandra Orchard y Henning Hermjakob

La iniciativa de Estándares de proteómica de HUPO ha dedicado los últimos 6 años al diseño y la implementación de estándares comunes de informes e intercambio de datos que permiten la transferencia de datos de proteómica del originador al colaborador a un depósito público final inmediatamente antes de la publicación. La comunidad de usuarios ahora se beneficia de este trabajo, con formatos XML para intercambiar e importar datos a bases de datos, lo que permite el acceso directo y la comparabilidad independientemente de la instrumentación de origen. Los repositorios públicos ahora permiten a los investigadores ver y buscar datos experimentales publicados y los conjuntos de datos de referencia están disponibles para fines de evaluación comparativa. Las colaboraciones entre bases de datos están exponiendo estos conjuntos de datos a una audiencia cada vez mayor y permitiendo que se derive nueva y emocionante ciencia de los datos existentes.