ISSN: 2157-7609
Mohan Kumar, Mahima Kaushik, Swati Chaudhary y Shrikant Kukreti
La estructura de doble hélice del ADN ofrece varios sitios de unión para la interacción de ligandos o proteínas. Las interacciones que utilizan el surco menor, el surco mayor ya través de la intercalación son los principales tipos de mecanismos de unión de las interacciones ADN-ligando. La disminución de la intensidad de absorción junto con el cambio batocrómico es la indicación del modo de unión por intercalación del colorante en los pares de bases del ADN. En este estudio, se estudió la interacción de los colorantes de fenotiazina con ADN de timo de ternero (ctDNA) en tampón fisiológico (pH 7,4) mediante espectroscopia de desnaturalización UV-visible, fluorescencia, dicroísmo circular (CD) y UV-termal. Las constantes de unión se calcularon a diferentes temperaturas con la ayuda de espectroscopía de fluorescencia. Las señales de CD significan que la forma B del ADN podría volverse más compacta tras la unión de los colorantes. Además, se observa dicroísmo circular inducido que confirma la formación del complejo colorante-ADN. La estabilización de la doble hélice del ADN tras la unión con colorantes se confirmó mediante el aumento de la Tm de ctDNA. Según los perfiles de fusión térmica, se descubrió que el acetato de tionina es más prometedor para estabilizar la doble hélice del ADN, en comparación con otros dos colorantes. Además, las constantes de unión calculadas por fluorescencia están de acuerdo con el análisis de fusión térmica. Estos resultados son indicativos del modo de unión por intercalación entre los colorantes y el ADN. Se encuentra que la afinidad de unión de los colorantes al ADN es del orden de acetato de tionina > azul A > azure B. Dichos estudios preliminares facilitan nuestra comprensión sobre varios tipos de interacciones ADN-ligando y brindan pistas para diseñar fármacos nuevos y más efectivos.