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La secuenciación de ARN unicelular de líneas de células madre de cáncer de glioblastoma revela que la inestabilidad cromosómica conduce a perturbaciones extracelulares Organización Matriz

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Según la nueva clasificación de cánceres del Sistema Nervioso Central (SNC) de la Organización Mundial de la Salud (OMS) de 2016, el Glioblastoma Multiforme (GBM) es el tumor maligno más frecuente del SNC. GBM contiene una amplia gama de cambios genéticos y epigenéticos, lo que da como resultado una gran cantidad de subgrupos de mutaciones, algunos de los cuales han demostrado desempeñar un papel en la supervivencia independiente del paciente y la respuesta al tratamiento. A pesar de los avances en el tratamiento del GBM, los pacientes a los que se les diagnostican estos tumores suelen tener un mal pronóstico y una baja calidad de vida a medida que avanza la enfermedad. Los datos procesados por secuenciación de alto rendimiento de ARN unicelular para células madre de cáncer de glioma se tomaron de GEO-NCBI y se analizaron para descubrir las diferencias de expresión subyacentes en una sola célula madre neural de glioma (GSC) y una célula madre neural normal (NSC). . Hemos realizado análisis bioinformáticos en el perfil transcripcional de 134 muestras que constaban de 75 GSC y 59 NSC obtenidas del bioproyecto NCBI (PRJNA546254). Se realizó un análisis exploratorio que mostró patrones significativos de variación de la expresión génica entre el tumor GBM y la célula madre normal. Posteriormente, el análisis de expresión génica diferencial de Deseq2 identificó 383 genes expresados diferencialmente entre GSC y NSC [padj. valor <0,05, log2 veces el cambio (>=+/-1,5)]. Este estudio revela genes como LOX, LOX1, COL6A2, COL8A1, COL3A1, LUM, TGFB1, LAMA2, POSTN, MFAP5, MFAP2, FBN2, FLRT2 y HTRA1 como características clave contribuyendo a los procesos alterados de la organización de la matriz extracelular y las vías de organización estructural extracelular en el glioma. En conclusión, los resultados presentados aquí revelan nuevos conocimientos sobre la progresión de GBM y la identificación de nuevos genes implicados en la gliomagénesis, que podrían estudiarse más a fondo para lograr objetivos terapéuticos.