Virología y Micología
Acceso abierto

abstracto

Comparación de secuencias y análisis filogenético de varias secuencias emergentes Bocavirus porcinos y propuesta de nomenclatura

Shao-Lun Zhai, Xiao-Peng Li, Qin-Ling Chen, Sheng-Nan Chen, Wen-Kang Wei y Man-Lin Luo

El primer Bocavirus (parvovirus bovino 1, BPV1) fue descubierto en terneros con diarrea en 1961. Desde entonces,
han surgido series de bocavirus en muchos animales, incluidos perros, humanos, cerdos, gorilas, leones marinos de California,
y gatos Estos virus están asociados con enfermedades del tracto digestivo y del tracto respiratorio. Varios porcinos emergentes
bocavirus (PBoVs) han sido reportados en granjas porcinas en los últimos cuatro años. Sin embargo, la nomenclatura utilizada para
describir estos virus ha sido confuso e irregular. El objetivo de este estudio fue comparar las secuencias de
estos PBoV emergentes, realizar un análisis filogenético y presentar una propuesta con respecto a su nomenclatura.
Las secuencias del genoma de algunos PBoV y otros bocavirus se descargaron de la base de datos GenBank. Secuencia
similitud, mutación, deleción o inserción de secuencia y recombinación de secuencia entre los bocavirus de referencia fueron
obtenido mediante el software DNAStar, y su evolución genética se determinó mediante el software MEGA 5.1. Según
las diferencias en sus secuencias y estructura genómica, se propuso la nomenclatura de los PBoV y fueron
dividido en cuatro especies diferentes (de PBoV1 a PBoV4) y muchos genotipos diferentes. Entre ellos, tanto PBoV1
y PBoV2 tenían dos genotipos, PBoV1-a y PBoV1-b y PBoV2-a y PBoV2-a y PBoV2-b, respectivamente.
PBoV3 incluía tres genotipos, PBoV3-a, PBoV3-b y PBoV3-c, respectivamente. Además, para PBoV4, había en
menos ocho genotipos (PBoV4-a a PBoV4-h) en intraespecies. En conclusión, los PBoV estaban muy diversificados genéticamente.
La nomenclatura propuesta de PBoV se utilizó en los presentes estudios, podría ayudarnos a comprender mejor y
estandarizar la nomenclatura de los PBoV.