Clonación y transgénesis
Acceso abierto

abstracto

Análisis de secuencia del gen similar a la HMG-CoA sintasa de Brassica rapa

Hina Awais, Zahid Mushtaq, Sumaira Sarwar y Amer Jamil

Los terpenoides se sintetizan en las plantas a través de las vías del mevalonato (MVA) y del metileritritol fosfato (MEP), entre las que se encuentran el isopentenil difosfato (IPP ) como el metabolito intermedio central. La 3-hidroxi-3-metilglutaril-coenzima A sintasa (HMGS) es una enzima subsiguiente en la vía MVA de biosíntesis de isoprenoides y cataliza la condensación de acetil-CoA por acetoacetil-CoA para producir HMG-CoA. Diferentes genes de HMGS están presentes en diferentes especies de plantas y animales para la síntesis de metabolitos secundarios. El presente estudio fue planeado para comparar y analizar bioinformáticamente la secuencia del gen HMG-CoA de Brassica rapa con otras secuencias de diferentes especies. La secuencia del gen tiene una secuencia de ADN codificante de 925 pb y se envió al Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) con número de acceso. MF577077. El alineamiento de las secuencias de nucleótidos y proteínas se llevó a cabo a través de Geneious. La comparación bioinformática, incluido el análisis estructural y funcional de la secuencia del gen similar a la HMG-CoA sintasa aislada de Brassica rapa, se llevó a cabo utilizando diferentes herramientas y softwares bioinformáticos. Estas comparaciones dieron una mejor información sobre las propiedades, la diversidad genética y funcional de este gen junto con las sustituciones de aminoácidos.