Chen-Yi Chang1 , Su-xian Zeng2 , Yuan-Ding Ma1 , Jun-Wen Zheng1 , Xin Li1 , Chen-Yong Xiong1 , Hong-Jin Zhou1 , Chun Tao Wei1 , Zong-Qiang Li
Identificar los genes importantes que afectan las diferencias fenotípicas entre los cerdos Landrace y Debao, especialmente las diferencias en el metabolismo y el crecimiento muscular. Los genes expresados diferencialmente del psoas mayor se detectaron mediante la secuenciación del transcriptoma de ARNm en cerdos Landrace y Debao. Al extraer el ARN total del músculo psoas mayor del cerdo Landrace y el cerdo Debao, purificar el ARNm, construir la biblioteca de ADNc, realizar la secuenciación del transcriptoma y luego mediante la evaluación de la calidad de la secuenciación, sabemos que la calidad de la secuenciación de este estudio es relativamente alto. Se detectaron un total de 17 943 genes en todas las muestras, incluidos 17 870 genes conocidos y 73 genes nuevos. Genes definidos con |log2FC| mayor que 2 y valor Q menor que 0,001, y los cribó como genes expresados de forma significativamente diferencial. Se seleccionaron un total de 1661 genes expresados diferencialmente de las muestras de cerdos Landrace y cerdos Debao, entre los cuales 1255 genes estaban regulados diferencialmente al alza y 406 genes estaban regulados diferencialmente a la baja. A través del análisis diferencial de genes, se concluye que estos genes están involucrados principalmente en la regulación metabólica, el desarrollo de músculo y grasa y otros procesos, especialmente algunos genes funcionales importantes como MAPK14, FOS, SIRT1, KRAS, EGR1, CDNNB1, etc. En resumen , este estudio utilizó el método de secuenciación del transcriptoma, y luego seleccionó genes expresados diferencialmente entre cerdos Landrace y cerdos Debao a través del análisis de datos, y finalmente descartó genes importantes que afectan las diferencias fenotípicas, lo que brindó apoyo genético para criar mejores razas en el futuro.