Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto
ISSN: 0974-276X
ISSN: 0974-276X
Pramodkumar P Gupta, Shrinkhla Singh, Pritam Kumar Panda, Danish Ibrahim Jasnaik, Santosh S Chhajed y Virupaksha A Bastikar
El receptor gamma activado por el proliferador de peroxisomas codificado por el gen PPARG también se conoce como tipo II nuclear receptor en humanos juega un papel importante en la regulación del metabolismo de la glucosa, la diferenciación de adipocitos y sirve como un sensor de lípidos. Esto se ha implicado en la patología de diversas enfermedades como la obesidad, la diabetes, la aterosclerosis y el cáncer. En busca de fármacos que utilicen PPAR gamma como diana terapéutica para su inhibición: los enfoques de Insilico CADD se han utilizado ampliamente en este aspecto para comprender los aspectos moleculares intrínsecos y su interacción con los productos químicos. El cribado virtual basado en silico ayuda a identificar la molécula óptima entre el gran conjunto de datos para dilucidar los efectos en un objetivo particular a través de la interacción de unión y puede usarse para experimentos adicionales. En el presente estudio, se seleccionaron dos PPAR gamma/antagonistas GW9662 y T0070907 para este estudio, ya que sirven como terapias potentes para minimizar los efectos de PPAR gamma en enfermedades crónicas. Se examinó un conjunto de análogos estructurales de GW9662 y T0070907 de la base de datos pública de ZINC. El cribado basado en ligandos es seguido por una búsqueda de similitud del 80%, filtro de Lipinski, cribado basado en farmacóforos y basado en toxicidad. El cribado virtual basado en la estructura sigue la salida y el acoplamiento molecular final utilizando iGemdock y Autodock explicó la afinidad de unión y las interacciones farmacológicas. Los resultados entre el GW9662, T0070907 y los análogos estructurales cribados muestran una mejor afinidad de unión con respecto al primero con interacciones farmacológicas similares