Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

SARS-Cov-2 Viroporinas: una perspectiva multiómica desde los nucleótidos hasta los aminoácidos

Manish Sarkar1*, Paul Etheimer2, Victor Hannothiaux1*, Soham Saha1*

COVID-19 es causado por el SARS-CoV-2, que hasta ahora ha afectado a más de 500 millones de personas en todo el mundo y ha matado a más de 6 millones a partir del 1 de mayo de 2022. Las vacunas de uso de emergencia aprobadas salvaron la vida de una pandemia tan devastadora. Las viroporinas son actores importantes del ciclo de vida del SARS-CoV-2 y son fundamentales para su patogénesis. Estudiamos las dos viroporinas prominentes de la proteína SARS-CoV-2 (i) Orf3a y (ii) Envelope (E) desde un punto de vista secuencial y estructural. Orf3a es un canal iónico viral selectivo de cationes que se ha demostrado que interrumpe las vías endosómicas. La proteína E es una de las proteínas más conservadas entre el proteoma del SARS-CoV que afecta las vías relacionadas con ERGIC. El medio acuoso a través de las viroporinas media la translocación no selectiva de cationes, afectando la homeostasis iónica en los compartimentos celulares del huésped. Este desequilibrio iónico podría conducir potencialmente a una mayor respuesta inflamatoria en la célula huésped. Nuestros resultados arrojan luz sobre el mecanismo de acción de la viroporina, que puede aprovecharse potencialmente para el desarrollo de terapias antivirales. Nuestros resultados corroboran con los datos transcriptómicos publicados anteriormente de células alveolares pulmonares infectadas con COVID-19, donde las respuestas inflamatorias y los reguladores moleculares directamente afectados por la canalización de iones estaban regulados al alza.