Revista internacional de minería de datos biomédicos

Revista internacional de minería de datos biomédicos
Acceso abierto

ISSN: 2090-4924

abstracto

RILES, a novel engineered genetic-switch expression system for the temporal analysis of microRNA expression in small animal model

Patricio Baril

La subestimación del objetivo fugaz y espacial de la articulación de microARN (miARN) provoca la pérdida de datos significativos que asocian la articulación de miARN y el trabajo celular. En cualquier caso, comprobar el estado de miARN en condiciones (fisio)neuróticas es probar el resultado del pequeño tamaño y la parte dinámica de la articulación de miARN y la falta de pruebas de observación pertinentes para el examen longitudinal. Recientemente, construimos un marco de articulación de cambios hereditarios para detectar el movimiento del hardware de ARNi endógeno . El marco llamado RILES, por ARNi-Inducible Luciferase Expression System, que se modificó para que sea el miARN del interés el que encienda la declaración de la calidad de la luciferasa. En consecuencia, la utilidad de la articulación de miARN en célulasestá marcado por la salida de banderas de bioluminiscencia que se pueden observar sin esfuerzo utilizando equipo de bioluminiscencia estándar. Trajimos una verificación completa del concentrado de reglas al verificar el estado de myomiRs en los músculos esqueléticos, el miRNA-122 en el hígado y la guía transitoria de la articulación de miRNA-206 durante el avance de la descomposición sólida en ratones. Las pruebas de bioluminiscencia crearon información poderosa que conectó bien con el diseño de articulación de miARN identificado por QRT-PCR. Mostramos que RILES también ofrece una investigación de medición mundialde articulación de miARN que nunca se ha alcanzado, lo que permite recopilar datos aplicables sobre el trabajo de miARN que las estrategias de verificación habituales no pueden hacer. Dado que RILES es sencillo y flexible, aceptamos que esta técnica se sumará a una comprensión superior de la ciencia de miARN y podría completarse como un método de razonamiento para el avance de nuevas terapias de miARN.

Los microARN (miARN) son una clase de ARN no codificantes endógenos, de 18 a 25 nt de largo, que controlan postranscripcionalmente la manifestación de las cualidades eucarióticas de manera explícita. Los miARN actúan de forma autorizada sobre los objetivos del ARNm, especialmente en el lugar 3′ no traducido (3′UTR) mediante un componente de coincidencia de bases. Según el nivel de complementariedad, los miARN dificultan la interpretación o inician la corrupción del ARNm objetivo. Hasta este momento, se han reconocido más de 1000 miARN en el genoma humano y se prevé que dirijan el 60 % de todo el transcriptoma. Los miARN están involucrados en la mayoría de los procesos celulares, si no en todos, desde la expansión hasta la apoptosis.y separación, hasta la hematopoyesis, la planificación formativa y la organogénesis. En este sentido, no es de extrañar que la desregulación de los miARN también se haya relacionado con diversas enfermedades y que los operadores útiles basados ​​en ARNi muestren garantías como medicamentos curativos.

Las técnicas actuales utilizadas para decidir la salida de miARN han afectado enfáticamente nuestra comprensión de los trabajos naturales que desempeñan los miARN en condiciones fisiológicas y fisiopatológicas. Si bien la información producida no puede ser cuestionada, necesitan un objetivo espacial y, lo que es más importante, mundano. Las técnicas, por ejemplo, metodologías basadas en PCR), microarrays, Northern Smear y ELISA son completamente molestas y requieren una inspección y manipulación de tejidos complejas, lo que hace que estas estrategias sean inadmisibles para observar la guía de miARN durante las investigaciones longitudinales. Esto es especialmente complicado ya que los miARN se gestionan espaciotemporalmente y están sujetos a una impresionante variedad interindividual. Este manantial de naturaleza multifacética se articula cada vez más cuando la declaración de los miARN debe explorarse a nivel de todo ser vivo. Por ejemplo, está arraigado que los miARN están finamente dirigidos durante el avance de la etapa temprana y controlan sistemas administrativos complejos de articulación de calidad asociados con las elecciones de herencia celular y, por lo tanto, la morfogénesis. Además, en el crecimiento maligno, algunos miRNA están involucrados en las etapas iniciales de la mejora del tumor, mientras que pueden, en etapas posteriores, reprimir la disposición de las metástasis. Por lo tanto, la estimación normal de los miARN de una población heterogénea en un momento determinado menosprecia la pertinencia orgánica de la naturaleza subordinada en el tiempo de la guía de miARN al igual que la heterogeneidad de la articulación de miARN a nivel individual. Por lo tanto, esta información podría provocar la pérdida de datos significativos que asocian la articulación de miRNA y el trabajo celular. Atender estos impedimentos puede afectar legítimamente en campos de examen fundamentales y útiles. Las estrategias de imágenes subatómicas no invasivas posiblemente pueden conquistar estos confinamientos y brindar una estrategia electiva para considerar la articulación de miARN en condiciones fisiológicas. Sin embargo, la verificación continua de los miARN, en una forma de vida alucinante, es esencialmente inferible a partir de la corta longitud de los miARN. Esto podría aclarar el número establecido de informes en la redacción. La estrategia detallada primaria depende de la utilización de la calidad de periodista de luciferasa que transmite agrupaciones cuadradas correlativas a un miRNA particular en el 3'UTR de la calidad de luciferasa. De esta manera, cuando un miARN de interés se comunica en la célula, se une a la cuenta de luciferasa y reprime la creación de luciferasa. Así, la articulación de miARN en Las estrategias de imágenes subatómicas no invasivas posiblemente pueden conquistar estos confinamientos y brindar una estrategia electiva para considerar la articulación de miARN en condiciones fisiológicas. Sin embargo, la verificación continua de los miARN, en una forma de vida alucinante, es esencialmente inferible a partir de la corta longitud de los miARN. Esto podría aclarar el número establecido de informes en la redacción. La estrategia detallada primaria depende de la utilización de la calidad de periodista de luciferasa que transmite agrupaciones cuadradas correlativas a un miRNA particular en el 3'UTR de la calidad de luciferasa. De esta manera, cuando un miARN de interés se comunica en la célula, se une a la cuenta de luciferasa y reprime la creación de luciferasa. Así, la articulación de miARN en Las estrategias de imágenes subatómicas no invasivas posiblemente pueden conquistar estos confinamientos y brindar una estrategia electiva para considerar la articulación de miARN en condiciones fisiológicas. Sin embargo, la verificación continua de los miARN, en una forma de vida alucinante, es esencialmente inferible a partir de la corta longitud de los miARN. Esto podría aclarar el número establecido de informes en la redacción. La estrategia detallada primaria depende de la utilización de la calidad de periodista de luciferasa que transmite agrupaciones cuadradas correlativas a un miRNA particular en el 3'UTR de la calidad de luciferasa. De esta manera, cuando un miARN de interés se comunica en la célula, se une a la cuenta de luciferasa y reprime la creación de luciferasa. Así, la articulación de miARN en está probando esencialmente inferible de la longitud corta de miRNAs. Esto podría aclarar el número establecido de informes en la redacción. La estrategia detallada primaria depende de la utilización de la calidad de periodista de luciferasa que transmite agrupaciones cuadradas correlativas a un miRNA particular en el 3'UTR de la calidad de luciferasa. De esta manera, cuando un miARN de interés se comunica en la célula, se une a la cuenta de luciferasa y reprime la creación de luciferasa. Así, la articulación de miARN en está probando esencialmente inferible de la longitud corta de miRNAs. Esto podría aclarar el número establecido de informes en la redacción. La estrategia detallada primaria depende de la utilización de la calidad de periodista de luciferasa que transmite agrupaciones cuadradas correlativas a un miRNA particular en el 3'UTR de la calidad de luciferasa. De esta manera, cuando un miARN de interés se comunica en la célula, se une a la cuenta de luciferasa y reprime la creación de luciferasa. Así, la articulación de miARN en se vincula con el registro de luciferasa y reprime la creación de luciferasa. Así, la articulación de miARN en se vincula con el registro de luciferasa y reprime la creación de luciferasa. Así, la articulación de miARN ense caracteriza por una reducción de la señal de bioluminiscencia (Off-System). Sea como fuere, una metodología de imagen "negativa" de este tipo no es suficiente, ya que la pérdida de la señal de bioluminiscencia puede reflejar pautas vagas del anunciante de luciferasa o incluso el paso de células. Más recientemente, se han creado marcos de imágenes atómicas positivas (ON-frameworks) para vencer este impedimento. Una parte de estos marcos depende de la utilización de puntos de referencia atómicos de oligonucleótidos denominados con un fluoróforo hacia un lado y un extintor en el extremo opuesto. En la proximidad de un miARN en particular, la estructura de círculo de tallo de las guías se linealiza, aislando el fluoróforo del extintor. Por lo tanto, la señal de fluorescencia descargada en las célulasfue visto como relativo a la agrupación de miRNAs. Si bien este desarrollo habla de una metodología cada vez más exigente y completamente aprobada in vitro, este enfoque tiene limitaciones, principalmente la impotente afectación de las pruebas fluorogénicas en pequeñas criaturas y la aplicación limitada a la investigación de miARN comunicada desde células incrustadas in vivo . Además, se requieren métodos de estandarización complejos significativos debido a la necesidad de repetir la organización de las pruebas a lo largo de los exámenes longitudinales.

Aquí, representamos una estrategia novedosa, RILES, para detectar, progresivamente y en todo el tamaño del cuerpo de las criaturas vivas, el ejemplo de articulación dinámica de los miARN en condiciones fisiológicas y fisiopatológicas. Utilizando RILES, establecimos sin precedentes para ratones, la dinámica de articulación de un miARN en un modelo de enfermedad animal durante un período de 30 días. Nuestra técnica depende de la utilización del marco de cambio de calidad de cumate en el que el CuO, un administrador que restringe el ADN de la sucesión del represor de la proteína CymR, se sitúa entre la calidad correspondiente de la luciferasa y su anunciante. En este sentido, cuando el miRNA es útil, el represor CymR no se crea más y entonces se comunica la calidad de columnista de luciferasa. De esta manera, un instrumento subatómico central incorporado en nuestro marco es queLas partículas de RNAi (siRNA, miRNA, shRNA) tienen el límite de inductores explícitos. Esto es único en relación con la metodología habitual en la que la disposición 'ENCENDIDO/APAGADO' del marco de articulación está restringida por la expansión de inductores exógenos, por ejemplo, cumate, medicación antibiótica o doxiciclina, por ejemplo. La totalidad de los componentes administrativos para que este sistema funcione se reunieron en un solo plásmido para transfectar eficazmente células de mamíferos para exámenes in vitro o para estudios de bioluminiscencia in vivo.

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