Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Revisión de la predicción computacional de ARN endógeno competitivo

Sherin K y Achuthsankar S. Nair

Los microARN (miARN) son las moléculas reguladoras de genes que se unen a los elementos de respuesta de microARN (MRE) en el 3’ Regiones no traducidas (UTR) de ARNm. La actividad represiva de miRNA es contrarrestada por “esponjas de miRNA” o "ARN endógenos competidores (ARNce)" denominado debido a su naturaleza competitiva de secuestrar el efecto del miARN. Los ceRNA con múltiples MRE para un miRNA interactúan más, lo que da como resultado una capa de red de genes reguladores. La perturbación de la red ceRNA provoca diversas enfermedades, incluido el cáncer. Este descubrimiento ha aumentado el análisis de interacciones, redes y dinámicas de ceRNA. Actualmente, una serie de herramientas de predicción y análisis de interacciones ceRNA-ceRNA están disponibles en línea. Esta revisión se centra en la predicción computacional de pares de ARNm-ARNm que actúan como ARNce y su importancia en la terapéutica del ARN. Las herramientas de predicción computacional se comparan con respecto a los datos de entrada recuperados, las características consideradas y el método de predicción.