Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

Gráficos de rango para concordancia en estudios de comparación de medidas, con aplicación para replicar experimentos de espectrometría de masas

James A. Koziol, Anne C. Feng, Jingyi Yu, Noelle M. Griffin y Jan E. Schnitzer

Es importante investigar la reproducibilidad de las características de abundancia sin procesar de la espectrometría de masas (MS), como la recuento, número de péptidos y valores de intensidad de iones, al realizar mediciones de espectrometría de masas replicadas. La reproducibilidad se puede inferir de estos datos replicados, ya sea formalmente con análisis de técnicas de varianza o informalmente con procedimientos gráficos, en particular, diagramas de Bland-Altman en corridas pareadas. En esta nota, sugerimos gráficas de rango para proporcionar una generalización adecuada de las gráficas de Bland-Altman para experimentos con más de dos ejecuciones repetidas. Describimos gráficos de rango y su interpretación, e ilustramos su uso con datos de un estudio proteómico reciente relacionado con el análisis sin etiquetas.