Transcriptómica: Acceso Abierto
Acceso abierto

abstracto

La selección de puromicina confunde los perfiles de secuencia de ARN de eritroblastos humanos primarios

de Vasconcellos

La transducción lentiviral seguida de la determinación de puromicina es un método muy apreciado por su calidad
Pruebas de intercambio y articulación que utilizan una variedad de tipos de células, incluido el tallo hematopoyético humano y
células ancestrales. Independientemente de su amplia aplicación, la investigación sobre los posibles impactos de la puromicina bacteriana
La articulación de calidad de N-acetiltransferasa (pac) en sociedades de células de mamíferos es inadecuada. Aquí el potencial para
Se analizó la determinación de puromicina para influir en los perfiles transcriptómicos utilizando un modelo muy leído para
eritropoyesis humana. Los análisis se realizaron utilizando células CD34 (+) esenciales de seis humanos sanos adultos
contribuyentes transducidos con dos vectores lentivirales de codificación pac accesibles monetariamente y contrastados con no transducidos
células de control Se crearon perfiles de articulación de calidad de RNA-Seq en la fase proeritroblástica de
separación, en ese momento se examinó la articulación de calidad diferencial con DEseq2 en la programación de R-Studio.
Entre variedad benefactora en los perfiles de articulación de calidad y variedades entre puromicina eligió poblaciones
después de la transducción de los diferentes vectores lentivirales se demostró por grandes contrastes en los niveles de identificación de ARN
de menos del 0,1%. No obstante, la elección de puromicina después de la transducción de calidad pac provocó cambios críticos en el acabado. 5% del ARNm cuando se contrastó con los controles no transducidos. Los resultados proponen que el pensamiento debe ser
dada por la capacidad de la determinación de puromicina para desconcertar la traducción de los perfiles transcriptómicos de RNA-Seq.