Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto
ISSN: 0974-276X
ISSN: 0974-276X
Stanislav N Naryzhny, Maria A Maynskova, Victor G Zgoda, Natalia L Ronzhina, Svetlana E Novikova, Natalia V Belyakova, Olga A Kleyst, Olga K Legina, Rimma A Pantina y Michael V Filatov
La identificación y el análisis cuantitativo de diferentes proteoformas (especies de proteínas) presentes en una línea celular generada a partir de glioblastoma de alto grado se realizó mediante electroforesis bidimensional (2DE), espectrometría de masas (ESI LC-MS/MS), e inmunodetección. Se obtuvo un mapa de proteínas 2DE que contenía un extenso conjunto de datos que comprendía 937 puntos con 1542 identificaciones de proteínas únicas (proteoformas) de 600 genes. Además, se realizó otro conjunto de experimentos en los que se identificaron 16012 proteoformas codificadas por 4050 genes mediante MS/MS según su posición en 96 secciones de gel (píxeles). Se ha prestado especial atención a las proteínas que son los biomarcadores potenciales del glioblastoma. La lista de estos biomarcadores se compiló a partir de la literatura. A continuación, generamos los gráficos con información teórica y experimental sobre proteoformas codificadas por el mismo gen. Tal representación experimental virtual permitió una mejor visualización del estado de estos productos genéticos. Muchas proteínas, biomarcadores potenciales del glioblastoma también, se caracterizan por un alto número de especies de proteínas. Asumimos que estas especies podrían ser una fuente potencial de biomarcadores altamente específicos de glioblastoma.