Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

El perfil proteómico del sarcoma de Ewing revela un papel para TRAF6 en Proliferación y ribonucleoproteínas/procesamiento de ARN

Juan Madoz-Gurpide, David Herrero-Martin, Gonzalo Gomez-Lopez, Lourdes Hontecillas-Prieto, Michele Biscuola, Cristina Chamizo, Daniel Garcia-Dominguez, David Marcilla, Ana Teresa Amaral, Jose Luis Ordonez and Enrique de Alava

A pesar de los avances de la última década en la comprensión de la biología molecular del sarcoma de Ewing (ES), todavía nos falta entender los aspectos críticos, especialmente los relacionados con su génesis. En particular, se ha dedicado poco esfuerzo a la caracterización del componente proteico de los mecanismos y vías desplegados por la activación de la proteína de fusión resultante de la translocación cromosómica. Decidimos investigar las alteraciones proteicas de una línea celular ES portadora de una proteína de fusión representativa. La combinación de interferencia de ARN de EWSFLI1 en la línea celular ES TC-71, un análisis proteómico por electroforesis 2-D y posterior identificación por espectrometría de masas, y un estudio de sobrerrepresentación global detectó cambios en más de 500 puntos. Cuarenta y tres proteínas fueron identificadas como significativamente diferencialmente abundantes. Como era de esperar, encontramos y validamos cambios en las proteínas relacionadas con el procesamiento de nucleótidos, la regulación de la transcripción, las ribonucleoproteínas, las helicasas, el control y la proliferación del ciclo celular y los procesos metabólicos. Además, el factor 6 asociado al receptor de TNF se reveló como un nodo central. Nuestra estrategia mostró el potencial para revelar la interacción de proteínas asociada con las funciones conocidas de la proteína de fusión: unión a ADN y ARN para actuar como factores de transcripción aberrantes o potentes represores, o alterando el procesamiento de ARN.