Revista de Proteómica y Bioinformática
Acceso abierto

abstracto

El análisis proteómico proporciona información sobre la respuesta de Arabidopsis thaliana bajo LED de longitud de onda estrecha de luz de 595 nm

Nafiseh Yavari*, Mark G. Lefsrud

Un creciente cuerpo de evidencia ha destacado que una amplia gama de procesos de las plantas, incluidos el crecimiento, la fotosíntesis y la respuesta al estrés, están regulados por 595 nm luz. Sin embargo, se desconocen los mecanismos moleculares subyacentes a las señales inducidas por 595 nm. El objetivo de este trabajo fue estudiar los cambios proteómicos comparativos en hojas de plantas de Arabidopsis thaliana Col-0 tratadas con luz de onda estrecha de 595 nm o luz fluorescente durante 5 días. Las muestras de plantas cosechadas se analizaron mediante cromatografía líquida en línea RP-SCX-RP acoplada con un espectrómetro de masas LTQ, lo que resultó en la identificación de 1538 proteínas. Modelado de regresión lineal de proteínas’ la abundancia relativa reveló un total de 23 proteínas diferencialmente abundantes (DAP). El análisis funcional de estos DAP demostró el papel de varios mecanismos biológicos en A. la respuesta de thaliana a la luz de 595 nm, incluida la respuesta al estrés y los procesos metabólicos. Un análisis de red de estos DAP reveló la importancia de los mecanismos de regulación de energía y redox. Los análisis posteriores determinaron funciones potencialmente importantes para las proteínas asociadas con la glucólisis, el complejo ATP sintasa, la modificación de la pared celular y la membrana tilacoidal que pueden modular la respuesta adaptativa de la planta a la luz de 595 nm. También se identificó un enriquecimiento significativo de DAP para la capacidad de tolerancia de PSII, así como vías de señalización asociadas de Ca²⁺ y ROS. En conjunto, este estudio proporciona información importante sobre posibles vías moleculares que sostienen la respuesta de una planta a la luz de 595 nm.